RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216044.9

GTPBP1-201, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTPBP1, Length 5,126 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-201ENST00000216044 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 MAN1C1Q9NR34 630 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 ADCY6O43306 1168 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 THRAP10827 490 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 NPR3P17342 541 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 FDFT1P37268 417 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 TGM3Q08188 693 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 IFNEQ86WN2 208 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 ERP27Q96DN0 273 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 HSFY1Q96LI6 401 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 RAB6BQ9NRW1 208 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 AIM2O14862 343 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 APRTP07741 180 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 CENPAP49450 140 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 RAD23AP54725 363 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 PNKPQ96T60 521 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 WDR41Q9HAD4 459 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 RRN3Q9NYV6 651 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.89□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 DSG1Q02413 1049 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 TMEM192Q8IY95 271 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 C12orf29Q8N999 325 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 LHX5Q9H2C1 402 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 MKL2Q9ULH7 1088 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 RAD54BQ9Y620 910 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 BDNFP23560 247 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 EPHB2P29323 1055 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 WDR93Q6P2C0 686 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 KLHL3Q9UH77 587 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 TM4SF4P48230 202 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 ARMC3Q5W041 872 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 ERAP2Q6P179 960 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 MAGED4Q96JG8 741 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 PDLIM7Q9NR12 457 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 F8VP50 259 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 ZNF438Q7Z4V0 828 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 AGR3Q8TD06 166 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 JADE3Q92613 823 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 SPASTQ9UBP0 616 aa14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 DYTNA2CJ06 578 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 NAT9Q9BTE0 207 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 CCNG2Q16589 344 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 FAM228AQ86W67 206 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 DEFB106AQ8N104 65 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 TMEM199Q8N511 208 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 BORCS6Q96GS4 357 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 RGS5O15539 181 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 OSBPL6Q9BZF3 934 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 EFCAB1Q9HAE3 211 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 GLRA3O75311 464 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 LRG1P02750 347 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 SERPINB12Q96P63 405 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 PCMTD2Q9NV79 361 aa14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa14.86□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 SOCS7O14512 581 aa14.86□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GTPBP1-201ENST00000216044 BMP10O95393 424 aa14.86□□□□□ -0.03
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