RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 EPS15L1Q9UBC2 864 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ARHGEF37A1IGU5 675 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM114B3SHH9 223 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 B4GALT5O43286 388 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PROZP22891 400 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ADORA2AP29274 412 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 GRM1Q13255 1194 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 CEACAM7Q14002 265 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SULF1Q8IWU6 871 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 MCRS1Q96EZ8 462 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF597Q96LX8 424 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 GPR20Q99678 358 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 H3BNH8 94 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 STT3AP46977 705 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ENTPD1P49961 510 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PDK2Q15119 407 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 CARM1Q86X55 608 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 LZTR1Q8N653 840 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 EME1Q96AY2 570 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 OR52B2Q96RD2 323 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PRPSAP2O60256 369 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 METTL18O95568 372 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 HMGCRP04035 888 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ASPAP45381 313 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PHKA2P46019 1235 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PKNOX1P55347 436 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 MS4A2Q01362 244 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 MPP3Q13368 585 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TRPC3Q13507 836 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 HM13Q8TCT9 377 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 MAPK15Q8TD08 544 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 RANBP9Q96S59 729 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 CNPY3Q9BT09 278 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 VPS45Q9NRW7 570 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PTPRFP10586 1907 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 CENPFP49454 3210 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ADCY6O43306 1168 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PRKCBP05771 671 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 GPD1P21695 349 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 EPHA3P29320 983 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF699Q32M78 642 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM192Q8IY95 271 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 UNC5BQ8IZJ1 945 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PQLC3Q8N755 202 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 GIPC3Q8TF64 312 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 RCN3Q96D15 328 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 GCATO75600 419 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 BMP10O95393 424 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 MLH1P40692 756 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 HERC3Q15034 1050 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 SPATA33Q96N06 139 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 WDR41Q9HAD4 459 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 WDR27A2RRH5 827 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 CFLARO15519 480 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TGFB3P10600 412 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 TYK2P29597 1187 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA11-201ENST00000006015 KRT80Q6KB66 452 aa20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms