RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636169.1

EFHC1-215, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

Gene EFHC1, Length 4,308 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-215	ENST00000636169	PLIN1	O60240	522 aa		6.1	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	STK31	Q9BXU1	1019 aa		6.1	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		6.1	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169		E9PSI1	815 aa		6.1	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		6.1	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	MS4A1	P11836	297 aa		6.1	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	NECTIN2	Q92692	538 aa		6.1	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	KIF1B	O60333	1816 aa		6.1	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	CLTCL1	P53675	1640 aa		6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	NPHP1	O15259	732 aa		6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	LAMC1	P11047	1609 aa		6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	ORAI2	Q96SN7	254 aa		6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-215	ENST00000636169	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	RGS3	P49796	1198 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	ABCC11	Q96J66	1382 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	ADAMTS2	O95450	1211 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	NLRP1	Q9C000	1473 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169		A0A1W2PP64	1363 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	CHRNA2	Q15822	529 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	NGEF	Q8N5V2	710 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	PIK3C2G	O75747	1445 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	MYOM2	P54296	1465 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	APBB1	O00213	710 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	GNAI1	P63096	354 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	FCHSD2	O94868	740 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	TOM1	O60784	492 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	NSD2	O96028	1365 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	AGL	P35573	1532 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	DCTN1	Q14203	1278 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	COG6	Q9Y2V7	657 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	POLK	Q9UBT6	870 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	TMEM94	Q12767	1356 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	MCM10	Q7L590	875 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	DEPDC5	O75140	1603 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	MADD	Q8WXG6	1647 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	NFE2L2	Q16236	605 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	SIRT1	Q96EB6	747 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	WWC1	Q8IX03	1113 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	CRBN	Q96SW2	442 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-215	ENST00000636169	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		6.03	□□□□□ -1.44

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