RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619939.4

LHX1-204, Transcript of LIM homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene LHX1, Length 1,840 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1-204ENST00000619939 CCER2I3L3R5 266 aa20.63■□□□□ 0.89
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LHX1-204ENST00000619939 CABP1Q9NZU7 370 aa20.62■□□□□ 0.89
LHX1-204ENST00000619939 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
LHX1-204ENST00000619939 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
LHX1-204ENST00000619939 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
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LHX1-204ENST00000619939 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.5■□□□□ 0.87
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LHX1-204ENST00000619939 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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LHX1-204ENST00000619939 GLI3P10071 1580 aa20.29■□□□□ 0.84
LHX1-204ENST00000619939 MTHFSP49914 203 aa20.29■□□□□ 0.84
LHX1-204ENST00000619939 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
LHX1-204ENST00000619939 FAM83GA6ND36 823 aa20.28■□□□□ 0.84
LHX1-204ENST00000619939 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.27■□□□□ 0.84
LHX1-204ENST00000619939 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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LHX1-204ENST00000619939 CFAP53Q96M91 514 aa20.27■□□□□ 0.84
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