RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617119.4

UBE2V1-223, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 4 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-223	ENST00000617119	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	ERBB4	Q15303	1308 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		11.08	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		11.08	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		11.08	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		11.08	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	CFAP53	Q96M91	514 aa		11.08	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		11.07	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		11.07	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		11.07	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIF2C	Q99661	725 aa		11.07	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		11.07	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		11.07	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	NPAT	Q14207	1427 aa		11.07	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		11.07	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	AK9	Q5TCS8	1911 aa		11.07	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		11.06	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	MRE11	P49959	708 aa		11.06	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		11.06	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		11.05	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	NUCB1	Q02818	461 aa		11.05	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	HSCB	Q8IWL3	235 aa		11.05	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	CABP2	Q9NPB3	220 aa		11.05	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	NSD2	O96028	1365 aa		11.05	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119		A0A1W2PP64	1363 aa		11.04	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	SNX21	Q969T3	373 aa		11.04	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	LNPK	Q9C0E8	428 aa		11.04	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	ABCC11	Q96J66	1382 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	PIK3C2B	O00750	1634 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	MED14	O60244	1454 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		11.02	□□□□□ -0.64
UBE2V1-223	ENST00000617119	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	ESPN	B1AK53	854 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	TPM2	P07951	284 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	IL16	Q14005	1332 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	EVC2	Q86UK5	1308 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	11.01	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		11	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		11	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	RIPK4	P57078	832 aa		11	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	ABCC3	O15438	1527 aa		11	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		10.99	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		10.99	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		10.99	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	FYB1	O15117	783 aa		10.99	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	10.99	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		10.99	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		10.99	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	SSFA2	P28290	1259 aa		10.98	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		10.98	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		10.98	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		10.98	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIF16B	Q96L93	1317 aa		10.98	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		10.97	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	PTPRM	P28827	1452 aa		10.97	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		10.97	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		10.97	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		10.97	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		10.97	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	PIK3R4	Q99570	1358 aa		10.96	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	GGT6	Q6P531	493 aa		10.96	□□□□□ -0.65
UBE2V1-223	ENST00000617119	FBLN1	P23142	703 aa		10.96	□□□□□ -0.66
UBE2V1-223	ENST00000617119	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		10.96	□□□□□ -0.66
UBE2V1-223	ENST00000617119	TSPYL6	Q8N831	410 aa		10.96	□□□□□ -0.66
UBE2V1-223	ENST00000617119	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.66
UBE2V1-223	ENST00000617119	PTCH1	Q13635	1447 aa		10.96	□□□□□ -0.66

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