RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614192.4

SCOC-211, Transcript of short coiled-coil protein, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCOC, Length 1,959 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOC-211ENST00000614192 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SCOC-211ENST00000614192 PTPRUQ92729 1446 aa22.35■■□□□ 1.17
SCOC-211ENST00000614192 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.34■■□□□ 1.17
SCOC-211ENST00000614192 TBX22Q9Y458 520 aa22.34■■□□□ 1.17
SCOC-211ENST00000614192 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.34■■□□□ 1.17
SCOC-211ENST00000614192 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.34■■□□□ 1.17
SCOC-211ENST00000614192 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SCOC-211ENST00000614192 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.33■■□□□ 1.17
SCOC-211ENST00000614192 NEUROD2Q15784 382 aa22.33■■□□□ 1.17
SCOC-211ENST00000614192 CRBNQ96SW2 442 aa22.33■■□□□ 1.17
SCOC-211ENST00000614192 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.32■■□□□ 1.16
SCOC-211ENST00000614192 POLKQ9UBT6 870 aa22.32■■□□□ 1.16
SCOC-211ENST00000614192 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.31■■□□□ 1.16
SCOC-211ENST00000614192 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.31■■□□□ 1.16
SCOC-211ENST00000614192 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SCOC-211ENST00000614192 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SCOC-211ENST00000614192 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SCOC-211ENST00000614192 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SCOC-211ENST00000614192 AKAP12Q02952 1782 aa22.29■■□□□ 1.16
SCOC-211ENST00000614192 NME9Q86XW9 330 aa22.29■■□□□ 1.16
SCOC-211ENST00000614192 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.28■■□□□ 1.16
SCOC-211ENST00000614192 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.27■■□□□ 1.16
SCOC-211ENST00000614192 DIP2AQ14689 1571 aa22.27■■□□□ 1.16
SCOC-211ENST00000614192 PTCH1Q13635 1447 aa22.26■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 FBLN1P23142 703 aa22.26■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.25■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 BCAR3O75815 825 aa22.25■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.25■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 ITSN1Q15811 1721 aa22.25■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.25■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 FCHSD2O94868 740 aa22.23■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 COG3Q96JB2 828 aa22.22■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.21■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.21■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.21■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.21■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
SCOC-211ENST00000614192 ACEP12821 1306 aa22.2■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.2■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.18■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.18■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 PIK3R4Q99570 1358 aa22.18■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 IL13P35225 146 aa22.18■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 USP6P35125 1406 aa22.17■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 PDE3AQ14432 1141 aa22.17■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.17■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 NUTM2FA1L443 756 aa22.16■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 IL16Q14005 1332 aa22.16■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 SSH2Q76I76 1423 aa22.15■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 RIPK4P57078 832 aa22.15■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.15■■□□□ 1.14
SCOC-211ENST00000614192 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.14■■□□□ 1.13
SCOC-211ENST00000614192 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.14■■□□□ 1.13
SCOC-211ENST00000614192 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.13■■□□□ 1.13
SCOC-211ENST00000614192 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.13■■□□□ 1.13
SCOC-211ENST00000614192 PRKAR2BP31323 418 aa22.13■■□□□ 1.13
SCOC-211ENST00000614192 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SCOC-211ENST00000614192 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SCOC-211ENST00000614192 KCNA6P17658 529 aa22.12■■□□□ 1.13
SCOC-211ENST00000614192 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SCOC-211ENST00000614192 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SCOC-211ENST00000614192 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.1■■□□□ 1.13
SCOC-211ENST00000614192 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SCOC-211ENST00000614192 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.09■■□□□ 1.13
SCOC-211ENST00000614192 USP31Q70CQ4 1352 aa22.09■■□□□ 1.13
SCOC-211ENST00000614192 HMOX1P09601 288 aa22.08■■□□□ 1.13
SCOC-211ENST00000614192 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SCOC-211ENST00000614192 NEFMP07197 916 aa22.08■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.08■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.08■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.07■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 NFE2L2Q16236 605 aa22.07■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.07■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 MS4A1P11836 297 aa22.06■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 PANK1Q8TE04 598 aa22.06■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.03■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 COG6Q9Y2V7 657 aa22.03■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SCOC-211ENST00000614192 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SCOC-211ENST00000614192 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.01■■□□□ 1.11
SCOC-211ENST00000614192 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.01■■□□□ 1.11
SCOC-211ENST00000614192 RLBP1P12271 317 aa22.01■■□□□ 1.11
SCOC-211ENST00000614192 AAMPQ13685 434 aa22.01■■□□□ 1.11
SCOC-211ENST00000614192 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22■■□□□ 1.11
SCOC-211ENST00000614192 PEAK1Q9H792 1746 aa22■■□□□ 1.11
SCOC-211ENST00000614192 TNNQ9UQP3 1299 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms