RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609571.5

ATRNL1-209, Transcript of attractin like 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATRNL1, Length 1,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1-209ENST00000609571 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.15■■■■□ 3.38
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ATRNL1-209ENST00000609571 DUSP27Q5VZP5 1158 aa36.13■■■■□ 3.37
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ATRNL1-209ENST00000609571 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP36.11■■■■□ 3.37
ATRNL1-209ENST00000609571 PLEKHG3A1L390 1219 aa36.1■■■■□ 3.37
ATRNL1-209ENST00000609571 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.08■■■■□ 3.37
ATRNL1-209ENST00000609571 E9PSI1 815 aa36.07■■■■□ 3.36
ATRNL1-209ENST00000609571 AATKQ6ZMQ8 1374 aa36.05■■■■□ 3.36
ATRNL1-209ENST00000609571 NRKQ7Z2Y5 1582 aa36.05■■■■□ 3.36
ATRNL1-209ENST00000609571 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
ATRNL1-209ENST00000609571 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP36.04■■■■□ 3.36
ATRNL1-209ENST00000609571 CCDC27Q2M243 656 aa36.04■■■■□ 3.36
ATRNL1-209ENST00000609571 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
ATRNL1-209ENST00000609571 TCP11L2Q8N4U5 519 aa36.03■■■■□ 3.36
ATRNL1-209ENST00000609571 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.03■■■■□ 3.36
ATRNL1-209ENST00000609571 WWC1Q8IX03 1113 aa36.02■■■■□ 3.36
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ATRNL1-209ENST00000609571 POLKQ9UBT6 870 aa35.99■■■■□ 3.35
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ATRNL1-209ENST00000609571 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.97■■■■□ 3.35
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ATRNL1-209ENST00000609571 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.93■■■■□ 3.34
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ATRNL1-209ENST00000609571 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa35.92■■■■□ 3.34
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ATRNL1-209ENST00000609571 SSH2Q76I76 1423 aa35.91■■■■□ 3.34
ATRNL1-209ENST00000609571 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.9■■■■□ 3.34
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ATRNL1-209ENST00000609571 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.87■■■■□ 3.33
ATRNL1-209ENST00000609571 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.87■■■■□ 3.33
ATRNL1-209ENST00000609571 FCHSD2O94868 740 aa35.86■■■■□ 3.33
ATRNL1-209ENST00000609571 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
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ATRNL1-209ENST00000609571 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
ATRNL1-209ENST00000609571 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.85■■■■□ 3.33
ATRNL1-209ENST00000609571 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa35.85■■■■□ 3.33
ATRNL1-209ENST00000609571 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
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ATRNL1-209ENST00000609571 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
ATRNL1-209ENST00000609571 NUTM2FA1L443 756 aa35.82■■■■□ 3.32
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ATRNL1-209ENST00000609571 IL13P35225 146 aa35.77■■■■□ 3.32
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ATRNL1-209ENST00000609571 IL16Q14005 1332 aa35.73■■■■□ 3.31
ATRNL1-209ENST00000609571 NEFMP07197 916 aa35.72■■■■□ 3.31
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ATRNL1-209ENST00000609571 NWD1Q149M9 1564 aa35.72■■■■□ 3.31
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ATRNL1-209ENST00000609571 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
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ATRNL1-209ENST00000609571 HSPA2P54652 639 aa35.5■■■■□ 3.27
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