RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 PREX1Q8TCU6 1659 aa13.58□□□□□ -0.23
FCHO1-216ENST00000596536 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.23
FCHO1-216ENST00000596536 SMC4Q9NTJ3 1288 aa13.58□□□□□ -0.23
FCHO1-216ENST00000596536 IDI1Q13907 227 aa13.57□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa13.57□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa13.57□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 ITPRIPQ8IWB1 547 aa13.56□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 WDR63Q8IWG1 891 aa13.56□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 MYH16Q9H6N6 1097 aa13.56□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa13.56□□□□□ -0.24
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FCHO1-216ENST00000596536 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.55□□□□□ -0.24
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FCHO1-216ENST00000596536 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa13.54□□□□□ -0.24
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FCHO1-216ENST00000596536 PRAM1Q96QH2 718 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
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FCHO1-216ENST00000596536 AAMPQ13685 434 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 MVPQ14764 893 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 PPP6R1Q9UPN7 881 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 ADGRB1O14514 1584 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM27P14373 513 aa13.53□□□□□ -0.24
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FCHO1-216ENST00000596536 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa13.52□□□□□ -0.24
FCHO1-216ENST00000596536 BECN1Q14457 450 aa13.52□□□□□ -0.24
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FCHO1-216ENST00000596536 A0A1W2PP64 1363 aa13.52□□□□□ -0.25
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FCHO1-216ENST00000596536 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-216ENST00000596536 SLC52A1Q9NWF4 448 aa13.51□□□□□ -0.25
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FCHO1-216ENST00000596536 ZFYVE9O95405 1425 aa13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM35Q9UPQ4 493 aa13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-216ENST00000596536 MYO5BQ9ULV0 1848 aa13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-216ENST00000596536 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa13.51□□□□□ -0.25
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FCHO1-216ENST00000596536 TBC1D32Q96NH3 1257 aa13.48□□□□□ -0.25
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FCHO1-216ENST00000596536 TULP4Q9NRJ4 1543 aa13.48□□□□□ -0.25
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FCHO1-216ENST00000596536 C1orf115Q9H7X2 142 aa13.47□□□□□ -0.25
FCHO1-216ENST00000596536 LNPKQ9C0E8 428 aa13.47□□□□□ -0.25
FCHO1-216ENST00000596536 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
FCHO1-216ENST00000596536 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa13.47□□□□□ -0.25
FCHO1-216ENST00000596536 CDK19Q9BWU1 502 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-216ENST00000596536 TERF2IPQ9NYB0 399 aa13.46□□□□□ -0.25
FCHO1-216ENST00000596536 PRKAR2BP31323 418 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 SOX12O15370 315 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 C22orf23Q9BZE7 217 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 PRDM4Q9UKN5 801 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 NLRP1Q9C000 1473 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 PHACTR3Q96KR7 559 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 DDX19BQ9UMR2 479 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 PDE4CQ08493 712 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 ANTXR1Q9H6X2 564 aa13.42□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.42□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 ABCC11Q96J66 1382 aa13.42□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP13.42□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa13.42□□□□□ -0.26
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FCHO1-216ENST00000596536 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.41□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.41□□□□□ -0.26
FCHO1-216ENST00000596536 PDCL3Q9H2J4 239 aa13.41□□□□□ -0.26
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FCHO1-216ENST00000596536 ANKRD45Q5TZF3 282 aa13.39□□□□□ -0.27
FCHO1-216ENST00000596536 PANK2Q9BZ23 570 aa13.39□□□□□ -0.27
FCHO1-216ENST00000596536 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa13.39□□□□□ -0.27
FCHO1-216ENST00000596536 DCTN1Q14203 1278 aa13.39□□□□□ -0.27
FCHO1-216ENST00000596536 FAM83GA6ND36 823 aa13.39□□□□□ -0.27
FCHO1-216ENST00000596536 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
FCHO1-216ENST00000596536 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
FCHO1-216ENST00000596536 POLKQ9UBT6 870 aa13.39□□□□□ -0.27
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