RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 FYB1O15117 783 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-212ENST00000591041 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-212ENST00000591041 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ACEP12821 1306 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC21AQ8NDW8 1320 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-212ENST00000591041 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-212ENST00000591041 COG3Q96JB2 828 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-212ENST00000591041 GGNBP2Q9H3C7 697 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-212ENST00000591041 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-212ENST00000591041 NUTM2FA1L443 756 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-212ENST00000591041 NUDCQ9Y266 331 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-212ENST00000591041 USP6P35125 1406 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-212ENST00000591041 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-212ENST00000591041 NGEFQ8N5V2 710 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-212ENST00000591041 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-212ENST00000591041 MTHFSP49914 203 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-212ENST00000591041 DCCP43146 1447 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ATF3P18847 181 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-212ENST00000591041 AATKQ6ZMQ8 1374 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-212ENST00000591041 NRKQ7Z2Y5 1582 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PDE3BQ13370 1112 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAMTS8Q9UP79 889 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-212ENST00000591041 NME9Q86XW9 330 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-212ENST00000591041 CADPS2Q86UW7 1296 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-212ENST00000591041 MSH6P52701 1360 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM94Q12767 1356 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-212ENST00000591041 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-212ENST00000591041 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-212ENST00000591041 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-212ENST00000591041 SSH2Q76I76 1423 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF1AQ12756 1690 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-212ENST00000591041 PSME1Q06323 249 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-212ENST00000591041 USP31Q70CQ4 1352 aa29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-212ENST00000591041 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-212ENST00000591041 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-212ENST00000591041 NEFMP07197 916 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-212ENST00000591041 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-212ENST00000591041 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-212ENST00000591041 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-212ENST00000591041 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-212ENST00000591041 NEFLP07196 543 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-212ENST00000591041 RUNDC1Q96C34 613 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-212ENST00000591041 POLKQ9UBT6 870 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-212ENST00000591041 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-212ENST00000591041 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-212ENST00000591041 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-212ENST00000591041 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-212ENST00000591041 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-212ENST00000591041 SHPRHQ149N8 1683 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-212ENST00000591041 NLRP6P59044 892 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ABTB2Q8N961 1025 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-212ENST00000591041 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-212ENST00000591041 USP54Q70EL1 1684 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-212ENST00000591041 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-212ENST00000591041 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-212ENST00000591041 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-212ENST00000591041 MST1RQ04912 1400 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-212ENST00000591041 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-212ENST00000591041 PIK3C2AO00443 1686 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-212ENST00000591041 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-212ENST00000591041 FCHSD2O94868 740 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-212ENST00000591041 ORAI2Q96SN7 254 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-212ENST00000591041 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-212ENST00000591041 APAF1O14727 1248 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-212ENST00000591041 SBNO1A3KN83 1393 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXO3O43524 673 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-212ENST00000591041 AMPHP49418 695 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-212ENST00000591041 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-212ENST00000591041 FLT4P35916 1363 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA2Q08379 1002 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-212ENST00000591041 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-212ENST00000591041 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-212ENST00000591041 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-212ENST00000591041 RTL1A6NKG5 1358 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC27Q2M243 656 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-212ENST00000591041 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-212ENST00000591041 IL13P35225 146 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-212ENST00000591041 E9PSI1 815 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-212ENST00000591041 SOX12O15370 315 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR63Q8IWG1 891 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-212ENST00000591041 SLAIN2Q9P270 581 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-212ENST00000591041 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF521Q96K83 1311 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGEF10O15013 1369 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-212ENST00000591041 FBLN1P23142 703 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-212ENST00000591041 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
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