RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 IFFO2Q5TF58 517 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 LAPTM4BQ86VI4 370 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 KIF14Q15058 1648 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP3K7O43318 606 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 WBP1LQ9NX94 342 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 RGS22Q8NE09 1264 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 CFAP74Q9C0B2 1584 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A0G2JS52 829 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 MYO5CQ9NQX4 1742 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 GRXCR2A6NFK2 248 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 MS4A1P11836 297 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 AEBP1Q8IUX7 1158 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 SMAPO00193 183 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 OSBPP22059 807 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 PDE4CQ08493 712 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 TMCO4Q5TGY1 634 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP10AO60312 1499 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 POGZQ7Z3K3 1410 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP3K1Q13233 1512 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 MLECQ14165 292 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 TSPY4P0CV99 314 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 TSPY10P0CW01 314 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 RICTORQ6R327 1708 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 YEATS2Q9ULM3 1422 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 FECHP22830 423 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 CDCA7LQ96GN5 454 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa11.58□□□□□ -0.55
EFTUD2-216ENST00000590105 NCOA2Q15596 1464 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 MLH3Q9UHC1 1453 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 HPS5Q9UPZ3 1129 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 TIAM1Q13009 1591 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 CLCN1P35523 988 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 PREX2Q70Z35 1606 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 PRSS12P56730 875 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 PACS2Q86VP3 889 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 RETREG2Q8NC44 543 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 BANK1Q8NDB2 785 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 POM121Q96HA1 1249 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 LRCH3Q96II8 777 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 PTGDRQ13258 359 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 MTMR7Q9Y216 660 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 ABCC1P33527 1531 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 MBD5Q9P267 1494 aa11.52□□□□□ -0.56
EFTUD2-216ENST00000590105 COG6Q9Y2V7 657 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 KDM5CP41229 1560 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 MIA2Q96PC5 1412 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 GGT6Q6P531 493 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 TATDN2Q93075 761 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 RGS20O76081 388 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 PTPRMP28827 1452 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 ADAMTSL3P82987 1691 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 ITSN2Q9NZM3 1697 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-216ENST00000590105 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms