RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587324.1

UBXN6-204, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 712 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-204ENST00000587324 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
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UBXN6-204ENST00000587324 MYT1Q01538 1121 aa27.76■■■□□ 2.03
UBXN6-204ENST00000587324 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
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UBXN6-204ENST00000587324 FAM182BQ5T319 152 aa27.74■■■□□ 2.03
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UBXN6-204ENST00000587324 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.73■■■□□ 2.03
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UBXN6-204ENST00000587324 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
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UBXN6-204ENST00000587324 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.62■■■□□ 2.01
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UBXN6-204ENST00000587324 CDK19Q9BWU1 502 aa27.52■■■□□ 2
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UBXN6-204ENST00000587324 ABTB2Q8N961 1025 aa27.38■■□□□ 1.97
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UBXN6-204ENST00000587324 COL18A1P39060 1754 aa27.37■■□□□ 1.97
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UBXN6-204ENST00000587324 CRB1P82279 1406 aa27.3■■□□□ 1.96
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UBXN6-204ENST00000587324 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.22■■□□□ 1.95
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UBXN6-204ENST00000587324 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.21■■□□□ 1.95
UBXN6-204ENST00000587324 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
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UBXN6-204ENST00000587324 NLRP6P59044 892 aa27.19■■□□□ 1.94
UBXN6-204ENST00000587324 UTRNP46939 3433 aa27.19■■□□□ 1.94
UBXN6-204ENST00000587324 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
UBXN6-204ENST00000587324 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.18■■□□□ 1.94
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