RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580838.1

PTPRM-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 676 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-212ENST00000580838 DESI1Q6ICB0 168 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 ZNF511Q8NB15 262 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 ZMYND10O75800 440 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 NACADO15069 1562 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 GMPRP36959 345 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 VEGFBP49765 207 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 MPNDQ8N594 471 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 ZFP42Q96MM3 310 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 NNTQ13423 1086 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 TBC1D2Q9BYX2 928 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 SCRIBQ14160 1630 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 H3BM21 787 aa9.09□□□□□ -0.95
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PTPRM-212ENST00000580838 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 LYPD8Q6UX82 237 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRM-212ENST00000580838 CFAP99D6REC4 459 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 TIMP2P16035 220 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 IRF7Q92985 503 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 ERBB4Q15303 1308 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 CTHP32929 405 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 FOXJ1Q92949 421 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 SPTLC1O15269 473 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 ADH1CP00326 375 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 MAP10Q9P2G4 905 aa9.05□□□□□ -0.96
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PTPRM-212ENST00000580838 SOBPA7XYQ1 873 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRM-212ENST00000580838 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.03□□□□□ -0.96
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PTPRM-212ENST00000580838 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.02□□□□□ -0.97
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PTPRM-212ENST00000580838 TRIM66O15016 1216 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRM-212ENST00000580838 ARID5BQ14865 1188 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRM-212ENST00000580838 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRM-212ENST00000580838 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRM-212ENST00000580838 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRM-212ENST00000580838 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
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PTPRM-212ENST00000580838 GRM5P41594 1212 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRM-212ENST00000580838 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRM-212ENST00000580838 VSIG8P0DPA2 414 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRM-212ENST00000580838 NR5A1Q13285 461 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRM-212ENST00000580838 AGERQ15109 404 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRM-212ENST00000580838 QPCTQ16769 361 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRM-212ENST00000580838 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRM-212ENST00000580838 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.96□□□□□ -0.98
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PTPRM-212ENST00000580838 MAN1A2O60476 641 aa8.94□□□□□ -0.98
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PTPRM-212ENST00000580838 TSC1Q92574 1164 aa8.94□□□□□ -0.98
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PTPRM-212ENST00000580838 MEIOBQ8N635 442 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-212ENST00000580838 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-212ENST00000580838 LILRB3O75022 631 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-212ENST00000580838 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-212ENST00000580838 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.92□□□□□ -0.98
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PTPRM-212ENST00000580838 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
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PTPRM-212ENST00000580838 BMP2P12643 396 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRM-212ENST00000580838 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRM-212ENST00000580838 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRM-212ENST00000580838 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRM-212ENST00000580838 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRM-212ENST00000580838 FSHRP23945 695 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRM-212ENST00000580838 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRM-212ENST00000580838 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRM-212ENST00000580838 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.9□□□□□ -0.98
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PTPRM-212ENST00000580838 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PTPRM-212ENST00000580838 UPP2O95045 317 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRM-212ENST00000580838 PDE4DQ08499 809 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRM-212ENST00000580838 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRM-212ENST00000580838 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRM-212ENST00000580838 NBPF14Q5TI25 921 aa8.88□□□□□ -0.99
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