RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 XBP1P17861 261 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 H0YHG0 523 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC173Q0VFZ6 552 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 CDR1P51861 262 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 NLRP6P59044 892 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 SMC2O95347 1197 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 RDXP35241 583 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 KINO60870 393 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 HIP1O00291 1037 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 GNAI2P04899 355 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 CAGE1Q8TC20 777 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 FIBPO43427 364 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 BACH2Q9BYV9 841 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 EPS15P42566 896 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 PDCP20941 246 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 MTMR7Q9Y216 660 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 RRP9O43818 475 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 SART3Q15020 963 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 CFTRP13569 1480 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 OFD1O75665 1012 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 SPC24Q8NBT2 197 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 SLC4A2P04920 1241 aa25.45■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 ATF3P18847 181 aa25.45■■□□□ 1.67
PTPRM-211ENST00000580170 ATP2B1P20020 1258 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 CCP110O43303 1012 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 LEKR1Q6ZMV7 388 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 ABTB2Q8N961 1025 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 STK38Q15208 465 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 ARAP1Q96P48 1450 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 PRAM1Q96QH2 718 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 FILIP1LQ4L180 1135 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 OSCARQ8IYS5 282 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 ODF2Q5BJF6 829 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 SMARCE1Q969G3 411 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 WDR63Q8IWG1 891 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 DCTN1Q14203 1278 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 STK3Q13188 491 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 HFM1A2PYH4 1435 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 AFAP1Q8N556 730 aa25.39■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.39■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO3Q9UK99 471 aa25.39■■□□□ 1.66
PTPRM-211ENST00000580170 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC192P0DO97 292 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 FAM177BA6PVY3 158 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 ERBINQ96RT1 1412 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 TNMDQ9H2S6 317 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD1Q15327 319 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 UQCRHLA0A096LP55 91 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 UQCRHP07919 91 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-211ENST00000580170 TXLNAP40222 546 aa25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms