RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-217ENST00000576589 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa39.83■■■■□ 3.97
NOMO3-217ENST00000576589 PLEKHG5O94827 1062 aa39.83■■■■□ 3.97
NOMO3-217ENST00000576589 CABP1Q9NZU7 370 aa39.83■■■■□ 3.97
NOMO3-217ENST00000576589 CABLES1Q8TDN4 633 aa39.8■■■■□ 3.96
NOMO3-217ENST00000576589 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa39.79■■■■□ 3.96
NOMO3-217ENST00000576589 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
NOMO3-217ENST00000576589 ATRNO75882 1429 aa39.79■■■■□ 3.96
NOMO3-217ENST00000576589 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
NOMO3-217ENST00000576589 ATAD2Q6PL18 1390 aa39.74■■■■□ 3.95
NOMO3-217ENST00000576589 BCL9LQ86UU0 1499 aa39.74■■■■□ 3.95
NOMO3-217ENST00000576589 USP47Q96K76 1375 aa39.72■■■■□ 3.95
NOMO3-217ENST00000576589 TESK2Q96S53 571 aa39.71■■■■□ 3.95
NOMO3-217ENST00000576589 ALS2Q96Q42 1657 aa39.68■■■■□ 3.94
NOMO3-217ENST00000576589 SLC24A1O60721 1099 aa39.67■■■■□ 3.94
NOMO3-217ENST00000576589 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
NOMO3-217ENST00000576589 NUTM2GQ5VZR2 741 aa39.64■■■■□ 3.94
NOMO3-217ENST00000576589 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
NOMO3-217ENST00000576589 ABTB2Q8N961 1025 aa39.63■■■■□ 3.93
NOMO3-217ENST00000576589 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
NOMO3-217ENST00000576589 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
NOMO3-217ENST00000576589 USP6P35125 1406 aa39.62■■■■□ 3.93
NOMO3-217ENST00000576589 TMC1Q8TDI8 760 aa39.59■■■■□ 3.93
NOMO3-217ENST00000576589 UNC5CLQ8IV45 518 aa39.58■■■■□ 3.93
NOMO3-217ENST00000576589 SLIT2O94813 1529 aa39.55■■■■□ 3.92
NOMO3-217ENST00000576589 TMF1P82094 1093 aa39.55■■■■□ 3.92
NOMO3-217ENST00000576589 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa39.54■■■■□ 3.92
NOMO3-217ENST00000576589 ABCA3Q99758 1704 aa39.54■■■■□ 3.92
NOMO3-217ENST00000576589 FAM83GA6ND36 823 aa39.53■■■■□ 3.92
NOMO3-217ENST00000576589 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
NOMO3-217ENST00000576589 SSH2Q76I76 1423 aa39.52■■■■□ 3.92
NOMO3-217ENST00000576589 NLRP13Q86W25 1043 aa39.52■■■■□ 3.92
NOMO3-217ENST00000576589 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
NOMO3-217ENST00000576589 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
NOMO3-217ENST00000576589 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa39.49■■■■□ 3.91
NOMO3-217ENST00000576589 NLRP6P59044 892 aa39.47■■■■□ 3.91
NOMO3-217ENST00000576589 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP39.47■■■■□ 3.91
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC125Q86Z20 511 aa39.47■■■■□ 3.91
NOMO3-217ENST00000576589 USP19O94966 1318 aa39.46■■■■□ 3.91
NOMO3-217ENST00000576589 PRDM11Q9NQV5 511 aa39.45■■■■□ 3.91
NOMO3-217ENST00000576589 TERF2IPQ9NYB0 399 aa39.45■■■■□ 3.91
NOMO3-217ENST00000576589 CD163L1Q9NR16 1453 aa39.43■■■■□ 3.9
NOMO3-217ENST00000576589 TTC21AQ8NDW8 1320 aa39.43■■■■□ 3.9
NOMO3-217ENST00000576589 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa39.43■■■■□ 3.9
NOMO3-217ENST00000576589 GLI3P10071 1580 aa39.43■■■■□ 3.9
NOMO3-217ENST00000576589 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
NOMO3-217ENST00000576589 EP400Q96L91 3159 aa39.43■■■■□ 3.9
NOMO3-217ENST00000576589 CDCA8Q53HL2 280 aa39.42■■■■□ 3.9
NOMO3-217ENST00000576589 KIAA0232Q92628 1395 aa39.42■■■■□ 3.9
NOMO3-217ENST00000576589 NINLQ9Y2I6 1382 aa39.42■■■■□ 3.9
NOMO3-217ENST00000576589 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP39.41■■■■□ 3.9
NOMO3-217ENST00000576589 GCP02774 474 aa39.4■■■■□ 3.9
NOMO3-217ENST00000576589 BTG4Q9NY30 223 aa39.4■■■■□ 3.9
NOMO3-217ENST00000576589 AKAP12Q02952 1782 aa39.4■■■■□ 3.9
NOMO3-217ENST00000576589 VPS72Q15906 364 aa39.39■■■■□ 3.9
NOMO3-217ENST00000576589 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP39.38■■■■□ 3.89
NOMO3-217ENST00000576589 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
NOMO3-217ENST00000576589 A0A1W2PP64 1363 aa39.37■■■■□ 3.89
NOMO3-217ENST00000576589 CHRNA2Q15822 529 aa39.37■■■■□ 3.89
NOMO3-217ENST00000576589 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
NOMO3-217ENST00000576589 ZRANB1Q9UGI0 708 aa39.35■■■■□ 3.89
NOMO3-217ENST00000576589 SEPT12Q8IYM1 358 aa39.34■■■■□ 3.89
NOMO3-217ENST00000576589 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
NOMO3-217ENST00000576589 PLCH1Q4KWH8 1693 aa39.33■■■■□ 3.89
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
NOMO3-217ENST00000576589 NRKQ7Z2Y5 1582 aa39.33■■■■□ 3.89
NOMO3-217ENST00000576589 PIK3C2AO00443 1686 aa39.32■■■■□ 3.89
NOMO3-217ENST00000576589 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
NOMO3-217ENST00000576589 CPDO75976 1380 aa39.31■■■■□ 3.88
NOMO3-217ENST00000576589 MON2Q7Z3U7 1717 aa39.31■■■■□ 3.88
NOMO3-217ENST00000576589 NWD2Q9ULI1 1742 aa39.31■■■■□ 3.88
NOMO3-217ENST00000576589 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP39.29■■■■□ 3.88
NOMO3-217ENST00000576589 NME9Q86XW9 330 aa39.29■■■■□ 3.88
NOMO3-217ENST00000576589 SLIT3O75094 1523 aa39.27■■■■□ 3.88
NOMO3-217ENST00000576589 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
NOMO3-217ENST00000576589 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa39.26■■■■□ 3.88
NOMO3-217ENST00000576589 ZBTB7CA1YPR0 619 aa39.25■■■■□ 3.87
NOMO3-217ENST00000576589 KCNH5Q8NCM2 988 aa39.25■■■■□ 3.87
NOMO3-217ENST00000576589 USP31Q70CQ4 1352 aa39.23■■■■□ 3.87
NOMO3-217ENST00000576589 SOX12O15370 315 aa39.23■■■■□ 3.87
NOMO3-217ENST00000576589 BRWD3Q6RI45 1802 aa39.22■■■■□ 3.87
NOMO3-217ENST00000576589 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa39.21■■■■□ 3.87
NOMO3-217ENST00000576589 STRN4Q9NRL3 753 aa39.21■■■■□ 3.87
NOMO3-217ENST00000576589 NRAPQ86VF7 1730 aa39.2■■■■□ 3.87
NOMO3-217ENST00000576589 POLR3GLQ9BT43 218 aa39.2■■■■□ 3.87
NOMO3-217ENST00000576589 EVA1CP58658 441 aa39.19■■■■□ 3.86
NOMO3-217ENST00000576589 KRT27Q7Z3Y8 459 aa39.19■■■■□ 3.86
NOMO3-217ENST00000576589 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP39.16■■■■□ 3.86
NOMO3-217ENST00000576589 DEFB132Q7Z7B7 95 aa39.15■■■■□ 3.86
NOMO3-217ENST00000576589 ARHGEF25Q86VW2 580 aa39.15■■■■□ 3.86
NOMO3-217ENST00000576589 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa39.14■■■■□ 3.86
NOMO3-217ENST00000576589 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa39.14■■■■□ 3.86
NOMO3-217ENST00000576589 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa39.14■■■■□ 3.86
NOMO3-217ENST00000576589 AATKQ6ZMQ8 1374 aa39.14■■■■□ 3.86
NOMO3-217ENST00000576589 A0A0G2JS52 829 aa39.14■■■■□ 3.86
NOMO3-217ENST00000576589 MYT1Q01538 1121 aa39.14■■■■□ 3.86
NOMO3-217ENST00000576589 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
NOMO3-217ENST00000576589 LMO7Q8WWI1 1683 aa39.09■■■■□ 3.85
NOMO3-217ENST00000576589 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa39.08■■■■□ 3.85
NOMO3-217ENST00000576589 OVOS2Q6IE36 1432 aa39.08■■■■□ 3.85
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