RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568485.1

E2F4-210, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 707 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-210ENST00000568485 BTG4Q9NY30 223 aa32.23■■■□□ 2.75
E2F4-210ENST00000568485 KRT27Q7Z3Y8 459 aa32.22■■■□□ 2.75
E2F4-210ENST00000568485 ITSN1Q15811 1721 aa32.21■■■□□ 2.75
E2F4-210ENST00000568485 DEFB132Q7Z7B7 95 aa32.2■■■□□ 2.75
E2F4-210ENST00000568485 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
E2F4-210ENST00000568485 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
E2F4-210ENST00000568485 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
E2F4-210ENST00000568485 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa32.16■■■□□ 2.74
E2F4-210ENST00000568485 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
E2F4-210ENST00000568485 CDK19Q9BWU1 502 aa32.14■■■□□ 2.74
E2F4-210ENST00000568485 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa32.14■■■□□ 2.74
E2F4-210ENST00000568485 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa32.13■■■□□ 2.73
E2F4-210ENST00000568485 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa32.13■■■□□ 2.73
E2F4-210ENST00000568485 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
E2F4-210ENST00000568485 A0A0G2JS52 829 aa32.12■■■□□ 2.73
E2F4-210ENST00000568485 MYT1Q01538 1121 aa32.12■■■□□ 2.73
E2F4-210ENST00000568485 PRDM11Q9NQV5 511 aa32.12■■■□□ 2.73
E2F4-210ENST00000568485 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
E2F4-210ENST00000568485 KIAA0232Q92628 1395 aa32.09■■■□□ 2.73
E2F4-210ENST00000568485 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa32.08■■■□□ 2.73
E2F4-210ENST00000568485 CCDC61Q9Y6R9 512 aa32.08■■■□□ 2.73
E2F4-210ENST00000568485 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa32.07■■■□□ 2.73
E2F4-210ENST00000568485 NBPF1Q3BBV0 1214 aa32.07■■■□□ 2.72
E2F4-210ENST00000568485 ACEP12821 1306 aa32.06■■■□□ 2.72
E2F4-210ENST00000568485 PLEKHG3A1L390 1219 aa32.05■■■□□ 2.72
E2F4-210ENST00000568485 NBPF8Q3BBV2 869 aa32.05■■■□□ 2.72
E2F4-210ENST00000568485 CHRNA2Q15822 529 aa32.02■■■□□ 2.72
E2F4-210ENST00000568485 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa32.01■■■□□ 2.72
E2F4-210ENST00000568485 BAG6P46379 1132 aa32.01■■■□□ 2.71
E2F4-210ENST00000568485 NUTM2GQ5VZR2 741 aa32.01■■■□□ 2.71
E2F4-210ENST00000568485 NRKQ7Z2Y5 1582 aa32■■■□□ 2.71
E2F4-210ENST00000568485 FAM182BQ5T319 152 aa31.99■■■□□ 2.71
E2F4-210ENST00000568485 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
E2F4-210ENST00000568485 RGPD1P0DJD0 1748 aa31.97■■■□□ 2.71
E2F4-210ENST00000568485 STRN4Q9NRL3 753 aa31.96■■■□□ 2.71
E2F4-210ENST00000568485 USP19O94966 1318 aa31.96■■■□□ 2.71
E2F4-210ENST00000568485 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
E2F4-210ENST00000568485 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa31.94■■■□□ 2.7
E2F4-210ENST00000568485 CPDO75976 1380 aa31.94■■■□□ 2.7
E2F4-210ENST00000568485 DISP2A7MBM2 1401 aa31.93■■■□□ 2.7
E2F4-210ENST00000568485 SSH2Q76I76 1423 aa31.93■■■□□ 2.7
E2F4-210ENST00000568485 ABTB2Q8N961 1025 aa31.93■■■□□ 2.7
E2F4-210ENST00000568485 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
E2F4-210ENST00000568485 LMO7Q8WWI1 1683 aa31.92■■■□□ 2.7
E2F4-210ENST00000568485 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa31.92■■■□□ 2.7
E2F4-210ENST00000568485 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
E2F4-210ENST00000568485 LRP5O75197 1615 aa31.91■■■□□ 2.7
E2F4-210ENST00000568485 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
E2F4-210ENST00000568485 CABP2Q9NPB3 220 aa31.9■■■□□ 2.7
E2F4-210ENST00000568485 QRICH2Q9H0J4 1663 aa31.89■■■□□ 2.7
E2F4-210ENST00000568485 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
E2F4-210ENST00000568485 BARGINQ6ZT62 677 aa31.87■■■□□ 2.69
E2F4-210ENST00000568485 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
E2F4-210ENST00000568485 L3MBTL2Q969R5 705 aa31.86■■■□□ 2.69
E2F4-210ENST00000568485 EVA1CP58658 441 aa31.85■■■□□ 2.69
E2F4-210ENST00000568485 NLRP13Q86W25 1043 aa31.85■■■□□ 2.69
E2F4-210ENST00000568485 USP35Q9P2H5 1018 aa31.85■■■□□ 2.69
E2F4-210ENST00000568485 GCP02774 474 aa31.84■■■□□ 2.69
E2F4-210ENST00000568485 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
E2F4-210ENST00000568485 FAM196AQ6ZSG2 479 aa31.84■■■□□ 2.69
E2F4-210ENST00000568485 USP6P35125 1406 aa31.83■■■□□ 2.69
E2F4-210ENST00000568485 CABP1Q9NZU7 370 aa31.81■■■□□ 2.68
E2F4-210ENST00000568485 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
E2F4-210ENST00000568485 TRIM37O94972 964 aa31.8■■■□□ 2.68
E2F4-210ENST00000568485 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa31.79■■■□□ 2.68
E2F4-210ENST00000568485 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
E2F4-210ENST00000568485 TCP11L2Q8N4U5 519 aa31.79■■■□□ 2.68
E2F4-210ENST00000568485 SLIT3O75094 1523 aa31.78■■■□□ 2.68
E2F4-210ENST00000568485 CAMKK2Q96RR4 588 aa31.77■■■□□ 2.68
E2F4-210ENST00000568485 SIN3AQ96ST3 1273 aa31.76■■■□□ 2.67
E2F4-210ENST00000568485 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
E2F4-210ENST00000568485 PDE3BQ13370 1112 aa31.74■■■□□ 2.67
E2F4-210ENST00000568485 EVC2Q86UK5 1308 aa31.74■■■□□ 2.67
E2F4-210ENST00000568485 NLRP6P59044 892 aa31.73■■■□□ 2.67
E2F4-210ENST00000568485 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
E2F4-210ENST00000568485 PIK3C2AO00443 1686 aa31.73■■■□□ 2.67
E2F4-210ENST00000568485 PARD3Q8TEW0 1356 aa31.72■■■□□ 2.67
E2F4-210ENST00000568485 AATKQ6ZMQ8 1374 aa31.71■■■□□ 2.67
E2F4-210ENST00000568485 APBA3O96018 575 aa31.71■■■□□ 2.67
E2F4-210ENST00000568485 CRB1P82279 1406 aa31.71■■■□□ 2.67
E2F4-210ENST00000568485 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
E2F4-210ENST00000568485 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
E2F4-210ENST00000568485 RREB1Q92766 1687 aa31.67■■■□□ 2.66
E2F4-210ENST00000568485 COL18A1P39060 1754 aa31.66■■■□□ 2.66
E2F4-210ENST00000568485 ZBTB7CA1YPR0 619 aa31.65■■■□□ 2.66
E2F4-210ENST00000568485 NEUROD1Q13562 356 aa31.64■■■□□ 2.66
E2F4-210ENST00000568485 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa31.63■■■□□ 2.65
E2F4-210ENST00000568485 AKAP12Q02952 1782 aa31.62■■■□□ 2.65
E2F4-210ENST00000568485 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
E2F4-210ENST00000568485 NUP188Q5SRE5 1749 aa31.62■■■□□ 2.65
E2F4-210ENST00000568485 PEAK1Q9H792 1746 aa31.61■■■□□ 2.65
E2F4-210ENST00000568485 LRRC37A3O60309 1634 aa31.61■■■□□ 2.65
E2F4-210ENST00000568485 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
E2F4-210ENST00000568485 AXIN2Q9Y2T1 843 aa31.6■■■□□ 2.65
E2F4-210ENST00000568485 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa31.58■■■□□ 2.65
E2F4-210ENST00000568485 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa31.58■■■□□ 2.65
E2F4-210ENST00000568485 OVOS2Q6IE36 1432 aa31.58■■■□□ 2.65
E2F4-210ENST00000568485 ARHGEF25Q86VW2 580 aa31.58■■■□□ 2.65
E2F4-210ENST00000568485 WDR17Q8IZU2 1322 aa31.57■■■□□ 2.64
E2F4-210ENST00000568485 TTC21AQ8NDW8 1320 aa31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms