RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	PIK3C2A	O00443	1686 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC7	Q96M83	1385 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	11.78	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	SBNO1	A3KN83	1393 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	JCAD	Q9P266	1359 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RPL4-208	ENST00000564744	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	SSH2	Q76I76	1423 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	LRP6	O75581	1613 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	NME9	Q86XW9	330 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	ABTB2	Q8N961	1025 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	PANK3	Q9H999	370 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	ARHGEF10	O15013	1369 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	SOX12	O15370	315 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	USP54	Q70EL1	1684 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	ADAMTS2	O95450	1211 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	NLRP6	P59044	892 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	LTN1	O94822	1766 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPL4-208	ENST00000564744	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		11.71	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	SLIT3	O75094	1523 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	RGPD5	Q99666	1765 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	NLRP13	Q86W25	1043 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	USP19	O94966	1318 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	NFAT5	O94916	1531 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	FYB1	O15117	783 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	USP31	Q70CQ4	1352 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	FBLN1	P23142	703 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	CHRNA2	Q15822	529 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	COG3	Q96JB2	828 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	C8orf37	Q96NL8	207 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	KIAA0232	Q92628	1395 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	GC	P02774	474 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	NRAP	Q86VF7	1730 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPL4-208	ENST00000564744	COL18A1	P39060	1754 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	PEAK1	Q9H792	1746 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	AFF2	P51816	1311 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	NGLY1	Q96IV0	654 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	FAM83G	A6ND36	823 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	MORC1	Q86VD1	984 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	NSD2	O96028	1365 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	SLIT2	O94813	1529 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPL4-208	ENST00000564744	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		11.6	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 307.9 ms