RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-208ENST00000563857 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
RNPS1-208ENST00000563857 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
RNPS1-208ENST00000563857 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
RNPS1-208ENST00000563857 CABP1Q9NZU7 370 aa22.62■■□□□ 1.21
RNPS1-208ENST00000563857 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.61■■□□□ 1.21
RNPS1-208ENST00000563857 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
RNPS1-208ENST00000563857 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
RNPS1-208ENST00000563857 NLRP13Q86W25 1043 aa22.58■■□□□ 1.21
RNPS1-208ENST00000563857 ABTB2Q8N961 1025 aa22.58■■□□□ 1.21
RNPS1-208ENST00000563857 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
RNPS1-208ENST00000563857 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.57■■□□□ 1.2
RNPS1-208ENST00000563857 CDCA8Q53HL2 280 aa22.56■■□□□ 1.2
RNPS1-208ENST00000563857 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.56■■□□□ 1.2
RNPS1-208ENST00000563857 ALS2Q96Q42 1657 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-208ENST00000563857 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-208ENST00000563857 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
RNPS1-208ENST00000563857 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-208ENST00000563857 USP6P35125 1406 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-208ENST00000563857 PLEKHG5O94827 1062 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-208ENST00000563857 TMF1P82094 1093 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-208ENST00000563857 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-208ENST00000563857 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.52■■□□□ 1.2
RNPS1-208ENST00000563857 ATRNO75882 1429 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-208ENST00000563857 SLIT2O94813 1529 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-208ENST00000563857 USP47Q96K76 1375 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-208ENST00000563857 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-208ENST00000563857 TMC1Q8TDI8 760 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-208ENST00000563857 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-208ENST00000563857 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-208ENST00000563857 FAM83GA6ND36 823 aa22.48■■□□□ 1.19
RNPS1-208ENST00000563857 NLRP6P59044 892 aa22.48■■□□□ 1.19
RNPS1-208ENST00000563857 VPS72Q15906 364 aa22.48■■□□□ 1.19
RNPS1-208ENST00000563857 TESK2Q96S53 571 aa22.48■■□□□ 1.19
RNPS1-208ENST00000563857 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RNPS1-208ENST00000563857 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RNPS1-208ENST00000563857 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.46■■□□□ 1.19
RNPS1-208ENST00000563857 ABCA3Q99758 1704 aa22.45■■□□□ 1.19
RNPS1-208ENST00000563857 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.45■■□□□ 1.18
RNPS1-208ENST00000563857 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.45■■□□□ 1.18
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
RNPS1-208ENST00000563857 USP19O94966 1318 aa22.45■■□□□ 1.18
RNPS1-208ENST00000563857 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.45■■□□□ 1.18
RNPS1-208ENST00000563857 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
RNPS1-208ENST00000563857 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
RNPS1-208ENST00000563857 BTG4Q9NY30 223 aa22.44■■□□□ 1.18
RNPS1-208ENST00000563857 GCP02774 474 aa22.43■■□□□ 1.18
RNPS1-208ENST00000563857 SSH2Q76I76 1423 aa22.42■■□□□ 1.18
RNPS1-208ENST00000563857 CPDO75976 1380 aa22.42■■□□□ 1.18
RNPS1-208ENST00000563857 KIAA0232Q92628 1395 aa22.41■■□□□ 1.18
RNPS1-208ENST00000563857 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RNPS1-208ENST00000563857 EVA1CP58658 441 aa22.4■■□□□ 1.18
RNPS1-208ENST00000563857 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
RNPS1-208ENST00000563857 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.4■■□□□ 1.18
RNPS1-208ENST00000563857 AKAP12Q02952 1782 aa22.39■■□□□ 1.17
RNPS1-208ENST00000563857 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.38■■□□□ 1.17
RNPS1-208ENST00000563857 RGS12O14924 1447 aa22.38■■□□□ 1.17
RNPS1-208ENST00000563857 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
RNPS1-208ENST00000563857 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.37■■□□□ 1.17
RNPS1-208ENST00000563857 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
RNPS1-208ENST00000563857 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
RNPS1-208ENST00000563857 USP31Q70CQ4 1352 aa22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-208ENST00000563857 CHRNA2Q15822 529 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-208ENST00000563857 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-208ENST00000563857 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.32■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.32■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 SLIT3O75094 1523 aa22.32■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.32■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.32■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.32■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.32■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 A0A1W2PP64 1363 aa22.31■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC125Q86Z20 511 aa22.31■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 STRN4Q9NRL3 753 aa22.31■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.3■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 A0A0G2JS52 829 aa22.3■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 MYT1Q01538 1121 aa22.3■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.3■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 PIK3C2AO00443 1686 aa22.29■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.28■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.28■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 GLI3P10071 1580 aa22.28■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 NRAPQ86VF7 1730 aa22.28■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 COG3Q96JB2 828 aa22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-208ENST00000563857 NME9Q86XW9 330 aa22.26■■□□□ 1.15
RNPS1-208ENST00000563857 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-208ENST00000563857 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-208ENST00000563857 BARGINQ6ZT62 677 aa22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-208ENST00000563857 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-208ENST00000563857 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-208ENST00000563857 ABCC6O95255 1503 aa22.23■■□□□ 1.15
RNPS1-208ENST00000563857 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.23■■□□□ 1.15
RNPS1-208ENST00000563857 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-208ENST00000563857 SOX12O15370 315 aa22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-208ENST00000563857 USP54Q70EL1 1684 aa22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-208ENST00000563857 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-208ENST00000563857 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-208ENST00000563857 CRB1P82279 1406 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms