RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 OATP04181 439 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-209ENST00000561136 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-209ENST00000561136 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-209ENST00000561136 FCHSD2O94868 740 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-209ENST00000561136 FAM69CQ0P6D2 419 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-209ENST00000561136 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-209ENST00000561136 HPS1Q92902 700 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-209ENST00000561136 KIFC2Q96AC6 838 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-209ENST00000561136 ABCC2Q92887 1545 aa9.1□□□□□ -0.95
TMOD3-209ENST00000561136 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.09□□□□□ -0.95
TMOD3-209ENST00000561136 ATP6V1AP38606 617 aa9.08□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM32Q13049 653 aa9.08□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 FECHP22830 423 aa9.07□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 GMPRP36959 345 aa9.07□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.07□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 BRICD5Q6PL45 260 aa9.06□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa9.05□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 MSS51Q4VC12 460 aa9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 KIF21BO75037 1637 aa9.02□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.96
TMOD3-209ENST00000561136 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 VEGFBP49765 207 aa9.02□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.02□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 NLRP7Q8WX94 980 aa9.02□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 BCANQ96GW7 911 aa9.02□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 GCGRP47871 477 aa9.01□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 ASXL2Q76L83 1435 aa9.01□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 IRF7Q92985 503 aa9.01□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 GLI2P10070 1586 aa9□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 IQGAP2Q13576 1575 aa8.99□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 BMP1P13497 986 aa8.98□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 DISP1Q96F81 1524 aa8.97□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 ALDH1A1P00352 501 aa8.97□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 HIC1Q14526 733 aa8.97□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
TMOD3-209ENST00000561136 KIAA0556O60303 1618 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 MMP16P51512 607 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 ERBB4Q15303 1308 aa8.96□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 H3BM21 787 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 SKOR1P84550 965 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 SULF1Q8IWU6 871 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 Q3C1V9 767 aa8.93□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 PTPRGP23470 1445 aa8.93□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 IGF1RP08069 1367 aa8.92□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 SEMA3EO15041 775 aa8.92□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.91□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.91□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.91□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 WNT7BP56706 349 aa8.91□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.9□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.9□□□□□ -0.98
TMOD3-209ENST00000561136 GNPATO15228 680 aa8.89□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 PHOX2BQ99453 314 aa8.89□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa8.89□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.89□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 KIF27Q86VH2 1401 aa8.88□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 UACAQ9BZF9 1416 aa8.88□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.88□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.88□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.88□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 MADDQ8WXG6 1647 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 ZFP42Q96MM3 310 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 ABCA8O94911 1581 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 SIAH2O43255 324 aa8.84□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.84□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 HLA-CQ95604 372 aa8.84□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.84□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
TMOD3-209ENST00000561136 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.83□□□□□ -1
TMOD3-209ENST00000561136 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms