RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 PHLPP1O60346 1717 aa25.68■■□□□ 1.7
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.67■■□□□ 1.7
USP3-AS1-203ENST00000559737 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
USP3-AS1-203ENST00000559737 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
USP3-AS1-203ENST00000559737 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.7
USP3-AS1-203ENST00000559737 SBNO1A3KN83 1393 aa25.64■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.63■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 NME9Q86XW9 330 aa25.62■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 ALS2Q96Q42 1657 aa25.62■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.61■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.61■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.6■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 PIK3C2AO00443 1686 aa25.6■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.6■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 FBXO41Q8TF61 875 aa25.6■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.59■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 FYB1O15117 783 aa25.59■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 HSPA1LP34931 641 aa25.59■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 ABTB2Q8N961 1025 aa25.59■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.59■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.58■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.58■■□□□ 1.69
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
USP3-AS1-203ENST00000559737 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.57■■□□□ 1.68
USP3-AS1-203ENST00000559737 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
USP3-AS1-203ENST00000559737 NLRP6P59044 892 aa25.54■■□□□ 1.68
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARHGEF10O15013 1369 aa25.53■■□□□ 1.68
USP3-AS1-203ENST00000559737 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
USP3-AS1-203ENST00000559737 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP31Q70CQ4 1352 aa25.52■■□□□ 1.68
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLEKHG5O94827 1062 aa25.52■■□□□ 1.68
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.51■■□□□ 1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.51■■□□□ 1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.51■■□□□ 1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.5■■□□□ 1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 NLRP13Q86W25 1043 aa25.5■■□□□ 1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP54Q70EL1 1684 aa25.5■■□□□ 1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.5■■□□□ 1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 COG3Q96JB2 828 aa25.49■■□□□ 1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 NSD2O96028 1365 aa25.49■■□□□ 1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.48■■□□□ 1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.47■■□□□ 1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP19O94966 1318 aa25.46■■□□□ 1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 SHPRHQ149N8 1683 aa25.46■■□□□ 1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 JCADQ9P266 1359 aa25.45■■□□□ 1.67
USP3-AS1-203ENST00000559737 MORC1Q86VD1 984 aa25.45■■□□□ 1.66
USP3-AS1-203ENST00000559737 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLIT3O75094 1523 aa25.43■■□□□ 1.66
USP3-AS1-203ENST00000559737 SOX12O15370 315 aa25.43■■□□□ 1.66
USP3-AS1-203ENST00000559737 ABCA3Q99758 1704 aa25.43■■□□□ 1.66
USP3-AS1-203ENST00000559737 FBLN1P23142 703 aa25.42■■□□□ 1.66
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
USP3-AS1-203ENST00000559737 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
USP3-AS1-203ENST00000559737 GCP02774 474 aa25.4■■□□□ 1.66
USP3-AS1-203ENST00000559737 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.38■■□□□ 1.65
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.37■■□□□ 1.65
USP3-AS1-203ENST00000559737 NFAT5O94916 1531 aa25.37■■□□□ 1.65
USP3-AS1-203ENST00000559737 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
USP3-AS1-203ENST00000559737 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
USP3-AS1-203ENST00000559737 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
USP3-AS1-203ENST00000559737 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANP32CO43423 234 aa25.34■■□□□ 1.65
USP3-AS1-203ENST00000559737 RALBP1Q15311 655 aa25.34■■□□□ 1.65
USP3-AS1-203ENST00000559737 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.33■■□□□ 1.65
USP3-AS1-203ENST00000559737 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.33■■□□□ 1.65
USP3-AS1-203ENST00000559737 LTN1O94822 1766 aa25.32■■□□□ 1.64
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.3■■□□□ 1.64
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.3■■□□□ 1.64
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP2R1AP30153 589 aa25.3■■□□□ 1.64
USP3-AS1-203ENST00000559737 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.3■■□□□ 1.64
USP3-AS1-203ENST00000559737 POLKQ9UBT6 870 aa25.3■■□□□ 1.64
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIAA0232Q92628 1395 aa25.3■■□□□ 1.64
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADAMTS2O95450 1211 aa25.29■■□□□ 1.64
USP3-AS1-203ENST00000559737 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.29■■□□□ 1.64
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRP6O75581 1613 aa25.29■■□□□ 1.64
USP3-AS1-203ENST00000559737 CPDO75976 1380 aa25.28■■□□□ 1.64
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHRNA2Q15822 529 aa25.27■■□□□ 1.64
USP3-AS1-203ENST00000559737 PEAK1Q9H792 1746 aa25.26■■□□□ 1.63
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.26■■□□□ 1.63
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
USP3-AS1-203ENST00000559737 MTHFSP49914 203 aa25.25■■□□□ 1.63
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM83GA6ND36 823 aa25.24■■□□□ 1.63
USP3-AS1-203ENST00000559737 COL18A1P39060 1754 aa25.24■■□□□ 1.63
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
USP3-AS1-203ENST00000559737 AMPHP49418 695 aa25.23■■□□□ 1.63
USP3-AS1-203ENST00000559737 RGPD5Q99666 1765 aa25.22■■□□□ 1.63
USP3-AS1-203ENST00000559737 HOXC9P31274 260 aa25.21■■□□□ 1.63
USP3-AS1-203ENST00000559737 IP6K1Q92551 441 aa25.2■■□□□ 1.63
USP3-AS1-203ENST00000559737 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms