RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
RABGGTA-208ENST00000558954 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
RABGGTA-208ENST00000558954 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
RABGGTA-208ENST00000558954 PIK3C2AO00443 1686 aa26.4■■□□□ 1.82
RABGGTA-208ENST00000558954 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
RABGGTA-208ENST00000558954 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
RABGGTA-208ENST00000558954 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.39■■□□□ 1.82
RABGGTA-208ENST00000558954 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.38■■□□□ 1.81
RABGGTA-208ENST00000558954 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
RABGGTA-208ENST00000558954 TMC1Q8TDI8 760 aa26.37■■□□□ 1.81
RABGGTA-208ENST00000558954 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
RABGGTA-208ENST00000558954 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
RABGGTA-208ENST00000558954 SSH2Q76I76 1423 aa26.34■■□□□ 1.81
RABGGTA-208ENST00000558954 USP54Q70EL1 1684 aa26.34■■□□□ 1.81
RABGGTA-208ENST00000558954 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.33■■□□□ 1.81
RABGGTA-208ENST00000558954 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.32■■□□□ 1.8
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.32■■□□□ 1.8
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A1W2PP64 1363 aa26.32■■□□□ 1.8
RABGGTA-208ENST00000558954 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
RABGGTA-208ENST00000558954 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
RABGGTA-208ENST00000558954 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.3■■□□□ 1.8
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.3■■□□□ 1.8
RABGGTA-208ENST00000558954 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
RABGGTA-208ENST00000558954 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
RABGGTA-208ENST00000558954 ADAMTS2O95450 1211 aa26.29■■□□□ 1.8
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.29■■□□□ 1.8
RABGGTA-208ENST00000558954 ABTB2Q8N961 1025 aa26.28■■□□□ 1.8
RABGGTA-208ENST00000558954 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.28■■□□□ 1.8
RABGGTA-208ENST00000558954 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.27■■□□□ 1.8
RABGGTA-208ENST00000558954 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
RABGGTA-208ENST00000558954 PLEKHG5O94827 1062 aa26.26■■□□□ 1.79
RABGGTA-208ENST00000558954 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.25■■□□□ 1.79
RABGGTA-208ENST00000558954 C8orf37Q96NL8 207 aa26.25■■□□□ 1.79
RABGGTA-208ENST00000558954 SLIT3O75094 1523 aa26.24■■□□□ 1.79
RABGGTA-208ENST00000558954 USP19O94966 1318 aa26.23■■□□□ 1.79
RABGGTA-208ENST00000558954 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.23■■□□□ 1.79
RABGGTA-208ENST00000558954 NLRP13Q86W25 1043 aa26.23■■□□□ 1.79
RABGGTA-208ENST00000558954 AFF2P51816 1311 aa26.21■■□□□ 1.79
RABGGTA-208ENST00000558954 NGLY1Q96IV0 654 aa26.21■■□□□ 1.79
RABGGTA-208ENST00000558954 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.2■■□□□ 1.78
RABGGTA-208ENST00000558954 NRAPQ86VF7 1730 aa26.19■■□□□ 1.78
RABGGTA-208ENST00000558954 NLRP6P59044 892 aa26.19■■□□□ 1.78
RABGGTA-208ENST00000558954 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
RABGGTA-208ENST00000558954 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
RABGGTA-208ENST00000558954 LTN1O94822 1766 aa26.19■■□□□ 1.78
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
RABGGTA-208ENST00000558954 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
RABGGTA-208ENST00000558954 SLIT2O94813 1529 aa26.17■■□□□ 1.78
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.17■■□□□ 1.78
RABGGTA-208ENST00000558954 USP31Q70CQ4 1352 aa26.15■■□□□ 1.78
RABGGTA-208ENST00000558954 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
RABGGTA-208ENST00000558954 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
RABGGTA-208ENST00000558954 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.14■■□□□ 1.78
RABGGTA-208ENST00000558954 NFAT5O94916 1531 aa26.14■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.14■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 CPDO75976 1380 aa26.13■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA0232Q92628 1395 aa26.13■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 NME9Q86XW9 330 aa26.13■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.13■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.13■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.12■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 ILDR2Q71H61 639 aa26.12■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.12■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 RGPD5Q99666 1765 aa26.12■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.12■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 GCP02774 474 aa26.11■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 USP21Q9UK80 565 aa26.11■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 COL18A1P39060 1754 aa26.1■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.09■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM83GA6ND36 823 aa26.08■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 POTEAQ6S8J7 498 aa26.08■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 ABCC6O95255 1503 aa26.08■■□□□ 1.77
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC7Q96M83 1385 aa26.07■■□□□ 1.76
RABGGTA-208ENST00000558954 ATRNO75882 1429 aa26.06■■□□□ 1.76
RABGGTA-208ENST00000558954 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.06■■□□□ 1.76
RABGGTA-208ENST00000558954 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.05■■□□□ 1.76
RABGGTA-208ENST00000558954 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.04■■□□□ 1.76
RABGGTA-208ENST00000558954 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
RABGGTA-208ENST00000558954 CHRNA2Q15822 529 aa26.03■■□□□ 1.76
RABGGTA-208ENST00000558954 COG3Q96JB2 828 aa26.03■■□□□ 1.76
RABGGTA-208ENST00000558954 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
RABGGTA-208ENST00000558954 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.03■■□□□ 1.76
RABGGTA-208ENST00000558954 SOX12O15370 315 aa26.02■■□□□ 1.76
RABGGTA-208ENST00000558954 BTG4Q9NY30 223 aa26.02■■□□□ 1.76
RABGGTA-208ENST00000558954 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.02■■□□□ 1.76
RABGGTA-208ENST00000558954 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.02■■□□□ 1.76
RABGGTA-208ENST00000558954 GLI3P10071 1580 aa26.01■■□□□ 1.75
RABGGTA-208ENST00000558954 PANK3Q9H999 370 aa26.01■■□□□ 1.75
RABGGTA-208ENST00000558954 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
RABGGTA-208ENST00000558954 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26■■□□□ 1.75
RABGGTA-208ENST00000558954 FYB1O15117 783 aa26■■□□□ 1.75
RABGGTA-208ENST00000558954 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
RABGGTA-208ENST00000558954 SOCS7O14512 581 aa25.98■■□□□ 1.75
RABGGTA-208ENST00000558954 RXRBP28702 533 aa25.98■■□□□ 1.75
RABGGTA-208ENST00000558954 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.98■■□□□ 1.75
RABGGTA-208ENST00000558954 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.97■■□□□ 1.75
RABGGTA-208ENST00000558954 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
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