RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 FUT2Q10981 343 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 GLI2P10070 1586 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 NR1I2O75469 434 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 RICTORQ6R327 1708 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.96□□□□□ -1.29
TMOD3-204ENST00000558666 ATP6V1AP38606 617 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 MORN1Q5T089 497 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 ATP10BO94823 1461 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 CLIP1P30622 1438 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 PREX2Q70Z35 1606 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 KDM4AO75164 1064 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 CEP162Q5TB80 1403 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 HOXA2O43364 376 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 ADH1BP00325 375 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 USP46P62068 366 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 PDE4DQ08499 809 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 MS4A1P11836 297 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 TEX14Q8IWB6 1497 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 RGS20O76081 388 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 HLA-CQ95604 372 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 THAP11Q96EK4 314 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 FMN1Q68DA7 1419 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 S1PR4O95977 384 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 GGCXP38435 758 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-204ENST00000558666 CD109Q6YHK3 1445 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 GUCA2AQ02747 115 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 SPSB2Q99619 263 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC18Q5T9S5 1454 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 TIAM1Q13009 1591 aa6.89□□□□□ -1.31
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TMOD3-204ENST00000558666 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 RNF223E7ERA6 249 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 Q3C1V9 767 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 BRICD5Q6PL45 260 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 ABCA6Q8N139 1617 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 MADDQ8WXG6 1647 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 FANCAO15360 1455 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 MSS51Q4VC12 460 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 FDX1P10109 184 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 BCORL1Q5H9F3 1711 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 ABCC1P33527 1531 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 ADGRL1O94910 1474 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 CROCC2H7BZ55 1655 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 NDUFV2P19404 249 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-204ENST00000558666 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-204ENST00000558666 GJA5P36382 358 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-204ENST00000558666 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-204ENST00000558666 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-204ENST00000558666 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-204ENST00000558666 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.82□□□□□ -1.32
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