RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	KLF15	Q9UIH9	416 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	PDE4D	Q08499	809 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	POLA2	Q14181	598 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	HMMR	O75330	724 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	E2F5	Q15329	346 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	MKL1	Q969V6	931 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	NAT1	P18440	290 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	CASQ1	P31415	396 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	FLT3	P36888	993 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	MCM6	Q14566	821 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CNOT2-231	ENST00000551483	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	KIF20A	O95235	890 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	PSME1	Q06323	249 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	PSMD2	Q13200	908 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	NBPF3	Q9H094	633 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	NPHP1	O15259	732 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	TPM3	P06753	285 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC4A2	P04920	1241 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	RRM1	P23921	792 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	ATIC	P31939	592 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	SPACA7	Q96KW9	195 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	PPFIA3	O75145	1194 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	TPM2	P07951	284 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	EVA1C	P58658	441 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	OGFOD1	Q8N543	542 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF853	P0CG23	659 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	NAT2	P11245	290 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	DMTN	Q08495	405 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	MIER1	Q8N108	512 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	ABL2	P42684	1182 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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