RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 ERBINQ96RT1 1412 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-225ENST00000551253 HTRA3P83110 453 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-225ENST00000551253 SLC15A2Q16348 729 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-225ENST00000551253 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 KRT28Q7Z3Y7 464 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 PROM2Q8N271 834 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 PCNTO95613 3336 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 PLEKHG5O94827 1062 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 KLHL34Q8N239 644 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 KIF15Q9NS87 1388 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 PSME1Q06323 249 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 ROBO2Q9HCK4 1378 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-225ENST00000551253 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 RGS19P49795 217 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 BARGINQ6ZT62 677 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 ABCA3Q99758 1704 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 POLD1P28340 1107 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 ARHGEF10O15013 1369 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 USP19O94966 1318 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 HFM1A2PYH4 1435 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 NUTM2FA1L443 756 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 TXNRD1Q16881 649 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 SBNO1A3KN83 1393 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 FSTL1Q12841 308 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 PRDM10Q9NQV6 1147 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 USP35Q9P2H5 1018 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-225ENST00000551253 TECPR2O15040 1411 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 ABHD8Q96I13 439 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 STRN4Q9NRL3 753 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 KIF1AQ12756 1690 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 PRDM11Q9NQV5 511 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 OVOS2Q6IE36 1432 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 SBF2Q86WG5 1849 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 TCP11L2Q8N4U5 519 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 TULP4Q9NRJ4 1543 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 NMRK2Q9NPI5 230 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 NAIPQ13075 1403 aa11.15□□□□□ -0.62
CS-225ENST00000551253 COL24A1Q17RW2 1714 aa11.15□□□□□ -0.63
CS-225ENST00000551253 PEAK1Q9H792 1746 aa11.15□□□□□ -0.63
CS-225ENST00000551253 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CS-225ENST00000551253 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CS-225ENST00000551253 EVA1CP58658 441 aa11.13□□□□□ -0.63
CS-225ENST00000551253 FOXN1O15353 648 aa11.12□□□□□ -0.63
CS-225ENST00000551253 CCDC85CA6NKD9 419 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-225ENST00000551253 ATP7BP35670 1465 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-225ENST00000551253 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-225ENST00000551253 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-225ENST00000551253 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-225ENST00000551253 CHRNA2Q15822 529 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-225ENST00000551253 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-225ENST00000551253 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-225ENST00000551253 BCL9O00512 1426 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-225ENST00000551253 SSH2Q76I76 1423 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-225ENST00000551253 NRXN1Q9ULB1 1477 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 KIAA0232Q92628 1395 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 ZNF827Q17R98 1081 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 FMN2Q9NZ56 1722 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 PAPPAQ13219 1627 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 DDB1Q16531 1140 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 WAPLQ7Z5K2 1190 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 SMC1BQ8NDV3 1235 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 AKT1S1Q96B36 256 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 E9PCH4 1651 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 VGFO15240 615 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 ALS2Q96Q42 1657 aa11.02□□□□□ -0.64
CS-225ENST00000551253 LBX1P52954 281 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-225ENST00000551253 AIDAQ96BJ3 306 aa11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms