RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ARHGEF10O15013 1369 aa9.88□□□□□ -0.83
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PTPRB-209ENST00000550857 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-209ENST00000550857 B4DLN1 442 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRB-209ENST00000550857 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
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PTPRB-209ENST00000550857 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-209ENST00000550857 PTPRKQ15262 1439 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-209ENST00000550857 GNAT3A8MTJ3 354 aa9.8□□□□□ -0.84
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