RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549107.5

PTPRR-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRR, Length 862 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-208ENST00000549107 HSPA2P54652 639 aa15.02■□□□□ -0
PTPRR-208ENST00000549107 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.02■□□□□ -0
PTPRR-208ENST00000549107 USP6P35125 1406 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRR-208ENST00000549107 MTHFSP49914 203 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRR-208ENST00000549107 NME9Q86XW9 330 aa15□□□□□ -0.01
PTPRR-208ENST00000549107 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRR-208ENST00000549107 CFAP53Q96M91 514 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRR-208ENST00000549107 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRR-208ENST00000549107 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRR-208ENST00000549107 SSH2Q76I76 1423 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRR-208ENST00000549107 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRR-208ENST00000549107 STRCQ7RTU9 1775 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRR-208ENST00000549107 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRR-208ENST00000549107 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRR-208ENST00000549107 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRR-208ENST00000549107 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 C14orf37Q86TY3 774 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 COG3Q96JB2 828 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 PNPLA6Q8IY17 1366 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 PIK3C2AO00443 1686 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 POLKQ9UBT6 870 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 NUDCQ9Y266 331 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 USP54Q70EL1 1684 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 TMEM94Q12767 1356 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 USP31Q70CQ4 1352 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 PDE3BQ13370 1112 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRR-208ENST00000549107 FBLN1P23142 703 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 DCCP43146 1447 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 KIF1AQ12756 1690 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 APAF1O14727 1248 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 RUNDC1Q96C34 613 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 CERKQ8TCT0 537 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 ZNF521Q96K83 1311 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 MST1RQ04912 1400 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 ILDR2Q71H61 639 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 NGEFQ8N5V2 710 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 PEAK1Q9H792 1746 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 NEFLP07196 543 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 ORAI2Q96SN7 254 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRR-208ENST00000549107 ATF3P18847 181 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 IL13P35225 146 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 NLRP6P59044 892 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 PSME1Q06323 249 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 MSH6P52701 1360 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 ABTB2Q8N961 1025 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 SOX12O15370 315 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 GOLGA2Q08379 1002 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 FKBP8Q14318 412 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 SBNO1A3KN83 1393 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 FOXO3O43524 673 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 MAP3K19Q56UN5 1328 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 FCHSD2O94868 740 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 FLT4P35916 1363 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRR-208ENST00000549107 SLFN5Q08AF3 891 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRR-208ENST00000549107 CCDC27Q2M243 656 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRR-208ENST00000549107 WWC1Q8IX03 1113 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRR-208ENST00000549107 NFAT5O94916 1531 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRR-208ENST00000549107 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms