RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-202ENST00000546471 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa11.9□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.9□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 KIF16BQ96L93 1317 aa11.9□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 MCM4P33991 863 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 HSCBQ8IWL3 235 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 SMC5Q8IY18 1101 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 PIK3C2BO00750 1634 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 GGNBP2Q9H3C7 697 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 TERF2IPQ9NYB0 399 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 MED14O60244 1454 aa11.87□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 ATAD2Q6PL18 1390 aa11.87□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 RIPK4P57078 832 aa11.87□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM57Q8N5G2 664 aa11.87□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa11.86□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa11.86□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa11.86□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.85□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 ALDH1L2Q3SY69 923 aa11.85□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 ZFYVE9O95405 1425 aa11.85□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 FSD2A1L4K1 749 aa11.85□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.85□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 NUCB1Q02818 461 aa11.85□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 STK26Q9P289 416 aa11.85□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 FYB1O15117 783 aa11.84□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAK2O60296 914 aa11.84□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 RBM25P49756 843 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
RRN3P1-202ENST00000546471 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 ARXQ96QS3 562 aa11.83□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF428Q96B54 188 aa11.83□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa11.83□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa11.83□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 CHD1LQ86WJ1 897 aa11.82□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 SNX21Q969T3 373 aa11.82□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 PTPRMP28827 1452 aa11.82□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 PNPLA6Q8IY17 1366 aa11.82□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 LNPKQ9C0E8 428 aa11.82□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 SLC52A1Q9NWF4 448 aa11.82□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 CD163L1Q9NR16 1453 aa11.81□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 FCHSD2O94868 740 aa11.81□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 IDI1Q13907 227 aa11.81□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 PRAM1Q96QH2 718 aa11.81□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa11.8□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 MRE11P49959 708 aa11.8□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 BMP2KLQ5H9B9 411 aa11.8□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 LRRC7Q96NW7 1537 aa11.8□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 GCC1Q96CN9 775 aa11.8□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa11.79□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 DDIT3P35638 169 aa11.79□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM135BQ49AJ0 1406 aa11.79□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.79□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa11.78□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 GBP4Q96PP9 640 aa11.78□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 PRKAR2BP31323 418 aa11.78□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 PANK2Q9BZ23 570 aa11.78□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 NEO1Q92859 1461 aa11.78□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 PTMSP20962 102 aa11.77□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 ANKRD45Q5TZF3 282 aa11.77□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 ARHGAP45Q92619 1136 aa11.77□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
RRN3P1-202ENST00000546471 CDK19Q9BWU1 502 aa11.77□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 PIK3R4Q99570 1358 aa11.77□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 PTCH1Q13635 1447 aa11.77□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 RAPGEF3O95398 923 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 NFE2L2Q16236 605 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 GRPEL1Q9HAV7 217 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 CABP1Q9NZU7 370 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 GNAI1P63096 354 aa11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 REREQ9P2R6 1566 aa11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms