RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539034.1

CLIP1-AS1-202, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLIP1-AS1, Length 447 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RFX1P22670 979 aa9.48□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.48□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TLL1O43897 1013 aa9.47□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.47□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SOX11P35716 441 aa9.46□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 Q3C1V9 767 aa9.46□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DESI1Q6ICB0 168 aa9.46□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 UCN2Q96RP3 112 aa9.46□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NR1I2O75469 434 aa9.45□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PDE4CQ08493 712 aa9.45□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.45□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RGS20O76081 388 aa9.43□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.43□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USTQ9Y2C2 406 aa9.43□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SEMA3FQ13275 785 aa9.42□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LYPD8Q6UX82 237 aa9.42□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PNMA1Q8ND90 353 aa9.42□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.41□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GGCXP38435 758 aa9.4□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 S1PR4O95977 384 aa9.39□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NR1H3Q13133 447 aa9.39□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.39□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ADH1BP00325 375 aa9.38□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SPSB2Q99619 263 aa9.38□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RNF223E7ERA6 249 aa9.37□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FBXO45P0C2W1 286 aa9.37□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BRICD5Q6PL45 260 aa9.37□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.37□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.37□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BRD1O95696 1058 aa9.36□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 THAP11Q96EK4 314 aa9.36□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.36□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZBBXA8MT70 800 aa9.35□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ATG7O95352 703 aa9.35□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.35□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MAP10Q9P2G4 905 aa9.35□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CARNS1A5YM72 827 aa9.34□□□□□ -0.91
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PIK3CDO00329 1044 aa9.32□□□□□ -0.92
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.3□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.3□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CTHP32929 405 aa9.29□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLC19A1P41440 591 aa9.29□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MSS51Q4VC12 460 aa9.29□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.29□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.28□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.28□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L3A6NCW0 530 aa9.27□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L4A6NCW7 530 aa9.27□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DXOO77932 396 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.27□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.27□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.27□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.27□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RGS22Q8NE09 1264 aa9.27□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 USP17L5A8MUK1 530 aa9.26□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SKIP12755 728 aa9.26□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.26□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.26□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.26□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GFRA3O60609 400 aa9.25□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.25□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MTMR7Q9Y216 660 aa9.25□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.25□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MMP16P51512 607 aa9.24□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KCNH2Q12809 1159 aa9.24□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.24□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.24□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.24□□□□□ -0.93
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