RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534197.5

GNPTG-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 3

Gene GNPTG, Length 420 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-209	ENST00000534197	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
GNPTG-209	ENST00000534197	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
GNPTG-209	ENST00000534197	CCDC125	Q86Z20	511 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GNPTG-209	ENST00000534197	CDK19	Q9BWU1	502 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GNPTG-209	ENST00000534197	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
GNPTG-209	ENST00000534197	BTG4	Q9NY30	223 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GNPTG-209	ENST00000534197	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GNPTG-209	ENST00000534197	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.72
GNPTG-209	ENST00000534197	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
GNPTG-209	ENST00000534197	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		31.98	■■■□□ 2.71
GNPTG-209	ENST00000534197	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
GNPTG-209	ENST00000534197	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
GNPTG-209	ENST00000534197	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		31.97	■■■□□ 2.71
GNPTG-209	ENST00000534197	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GNPTG-209	ENST00000534197	ACE	P12821	1306 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GNPTG-209	ENST00000534197	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		31.95	■■■□□ 2.71
GNPTG-209	ENST00000534197	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		31.95	■■■□□ 2.71
GNPTG-209	ENST00000534197	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GNPTG-209	ENST00000534197	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GNPTG-209	ENST00000534197	KIAA0232	Q92628	1395 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GNPTG-209	ENST00000534197	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		31.92	■■■□□ 2.7
GNPTG-209	ENST00000534197	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		31.92	■■■□□ 2.7
GNPTG-209	ENST00000534197	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		31.92	■■■□□ 2.7
GNPTG-209	ENST00000534197		A0A0G2JS52	829 aa		31.91	■■■□□ 2.7
GNPTG-209	ENST00000534197	MYT1	Q01538	1121 aa		31.91	■■■□□ 2.7
GNPTG-209	ENST00000534197	CHRNA2	Q15822	529 aa		31.91	■■■□□ 2.7
GNPTG-209	ENST00000534197	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		31.89	■■■□□ 2.7
GNPTG-209	ENST00000534197	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		31.89	■■■□□ 2.7
GNPTG-209	ENST00000534197	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		31.88	■■■□□ 2.69
GNPTG-209	ENST00000534197	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
GNPTG-209	ENST00000534197	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
GNPTG-209	ENST00000534197	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		31.87	■■■□□ 2.69
GNPTG-209	ENST00000534197	FAM182B	Q5T319	152 aa		31.86	■■■□□ 2.69
GNPTG-209	ENST00000534197	CABP2	Q9NPB3	220 aa		31.86	■■■□□ 2.69
GNPTG-209	ENST00000534197	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		31.85	■■■□□ 2.69
GNPTG-209	ENST00000534197	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		31.84	■■■□□ 2.69
GNPTG-209	ENST00000534197	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
GNPTG-209	ENST00000534197	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
GNPTG-209	ENST00000534197	ABTB2	Q8N961	1025 aa		31.82	■■■□□ 2.68
GNPTG-209	ENST00000534197	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		31.81	■■■□□ 2.68
GNPTG-209	ENST00000534197	STRN4	Q9NRL3	753 aa		31.81	■■■□□ 2.68
GNPTG-209	ENST00000534197	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		31.81	■■■□□ 2.68
GNPTG-209	ENST00000534197	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GNPTG-209	ENST00000534197	USP19	O94966	1318 aa		31.77	■■■□□ 2.68
GNPTG-209	ENST00000534197	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		31.76	■■■□□ 2.68
GNPTG-209	ENST00000534197	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		31.75	■■■□□ 2.67
GNPTG-209	ENST00000534197	NEUROD1	Q13562	356 aa		31.74	■■■□□ 2.67
GNPTG-209	ENST00000534197	CABP1	Q9NZU7	370 aa		31.74	■■■□□ 2.67
GNPTG-209	ENST00000534197	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
GNPTG-209	ENST00000534197	USP35	Q9P2H5	1018 aa		31.73	■■■□□ 2.67
GNPTG-209	ENST00000534197	SSH2	Q76I76	1423 aa		31.73	■■■□□ 2.67
GNPTG-209	ENST00000534197	CPD	O75976	1380 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GNPTG-209	ENST00000534197	BAG6	P46379	1132 aa		31.71	■■■□□ 2.67
GNPTG-209	ENST00000534197	USP6	P35125	1406 aa		31.7	■■■□□ 2.67
GNPTG-209	ENST00000534197	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
GNPTG-209	ENST00000534197	GC	P02774	474 aa		31.69	■■■□□ 2.66
GNPTG-209	ENST00000534197	EVA1C	P58658	441 aa		31.69	■■■□□ 2.66
GNPTG-209	ENST00000534197	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
GNPTG-209	ENST00000534197	NLRP13	Q86W25	1043 aa		31.69	■■■□□ 2.66
GNPTG-209	ENST00000534197	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
GNPTG-209	ENST00000534197	PIK3C2A	O00443	1686 aa		31.65	■■■□□ 2.66
GNPTG-209	ENST00000534197	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		31.65	■■■□□ 2.66
GNPTG-209	ENST00000534197	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.64	■■■□□ 2.66
GNPTG-209	ENST00000534197	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.66
GNPTG-209	ENST00000534197	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	31.63	■■■□□ 2.65
GNPTG-209	ENST00000534197	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	31.63	■■■□□ 2.65
GNPTG-209	ENST00000534197	SLIT3	O75094	1523 aa		31.62	■■■□□ 2.65
GNPTG-209	ENST00000534197	AKAP12	Q02952	1782 aa		31.61	■■■□□ 2.65
GNPTG-209	ENST00000534197	DISP2	A7MBM2	1401 aa		31.61	■■■□□ 2.65
GNPTG-209	ENST00000534197	TRIM37	O94972	964 aa		31.61	■■■□□ 2.65
GNPTG-209	ENST00000534197	NLRP6	P59044	892 aa		31.61	■■■□□ 2.65
GNPTG-209	ENST00000534197	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		31.6	■■■□□ 2.65
GNPTG-209	ENST00000534197	COL18A1	P39060	1754 aa		31.59	■■■□□ 2.65
GNPTG-209	ENST00000534197	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		31.59	■■■□□ 2.65
GNPTG-209	ENST00000534197	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		31.57	■■■□□ 2.64
GNPTG-209	ENST00000534197	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
GNPTG-209	ENST00000534197	LRP5	O75197	1615 aa		31.57	■■■□□ 2.64
GNPTG-209	ENST00000534197	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
GNPTG-209	ENST00000534197	PDE3B	Q13370	1112 aa		31.54	■■■□□ 2.64
GNPTG-209	ENST00000534197	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		31.54	■■■□□ 2.64
GNPTG-209	ENST00000534197	RGPD5	Q99666	1765 aa		31.53	■■■□□ 2.64
GNPTG-209	ENST00000534197	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		31.53	■■■□□ 2.64
GNPTG-209	ENST00000534197	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		31.52	■■■□□ 2.64
GNPTG-209	ENST00000534197	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
GNPTG-209	ENST00000534197	CRB1	P82279	1406 aa		31.51	■■■□□ 2.64
GNPTG-209	ENST00000534197	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		31.51	■■■□□ 2.63
GNPTG-209	ENST00000534197	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	31.5	■■■□□ 2.63
GNPTG-209	ENST00000534197	APBA3	O96018	575 aa		31.49	■■■□□ 2.63
GNPTG-209	ENST00000534197	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
GNPTG-209	ENST00000534197	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
GNPTG-209	ENST00000534197	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		31.46	■■■□□ 2.63
GNPTG-209	ENST00000534197	RREB1	Q92766	1687 aa		31.46	■■■□□ 2.63
GNPTG-209	ENST00000534197	LRRC37A3	O60309	1634 aa		31.46	■■■□□ 2.63
GNPTG-209	ENST00000534197	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		31.45	■■■□□ 2.63
GNPTG-209	ENST00000534197	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		31.45	■■■□□ 2.63
GNPTG-209	ENST00000534197	PEAK1	Q9H792	1746 aa		31.45	■■■□□ 2.63
GNPTG-209	ENST00000534197	SOX12	O15370	315 aa		31.44	■■■□□ 2.62
GNPTG-209	ENST00000534197	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		31.44	■■■□□ 2.62
GNPTG-209	ENST00000534197	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
GNPTG-209	ENST00000534197	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		31.43	■■■□□ 2.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms