RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.08■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-211ENST00000533653 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ACEP12821 1306 aa23.07■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.06■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.06■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMF1P82094 1093 aa23.04■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-211ENST00000533653 USP6P35125 1406 aa23.04■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDCA8Q53HL2 280 aa23.03■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.01■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CABP1Q9NZU7 370 aa23.01■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYOM1P52179 1685 aa22.99■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SSH2Q76I76 1423 aa22.99■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.98■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PIK3C2AO00443 1686 aa22.97■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-211ENST00000533653 USP54Q70EL1 1684 aa22.97■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.93■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.92■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.92■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.92■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A0A1W2PP64 1363 aa22.91■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.91■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMC1Q8TDI8 760 aa22.9■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLIT3O75094 1523 aa22.9■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.9■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 USP19O94966 1318 aa22.89■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABTB2Q8N961 1025 aa22.88■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.87■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADAMTS2O95450 1211 aa22.87■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RNF39Q9H2S5 420 aa22.87■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.87■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NLRP13Q86W25 1043 aa22.85■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C8orf37Q96NL8 207 aa22.85■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLIT2O94813 1529 aa22.85■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AFF2P51816 1311 aa22.84■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.84■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NRAPQ86VF7 1730 aa22.83■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.83■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 USP31Q70CQ4 1352 aa22.83■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NGLY1Q96IV0 654 aa22.82■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CPDO75976 1380 aa22.81■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABCC6O95255 1503 aa22.8■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.79■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.79■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.79■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NFAT5O94916 1531 aa22.78■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.78■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NLRP6P59044 892 aa22.78■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.77■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATRNO75882 1429 aa22.76■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 USP21Q9UK80 565 aa22.76■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIAA0232Q92628 1395 aa22.76■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.75■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GCP02774 474 aa22.74■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.237e-8■■■□□ 15.1
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.74■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.74■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LTN1O94822 1766 aa22.73■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POTEAQ6S8J7 498 aa22.73■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLEKHG5O94827 1062 aa22.72■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.72■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.72■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COL18A1P39060 1754 aa22.71■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NME9Q86XW9 330 aa22.71■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.71■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM83GA6ND36 823 aa22.7■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.69■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.68■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC7Q96M83 1385 aa22.67■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GLI3P10071 1580 aa22.67■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.66■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RXRBP28702 533 aa22.66■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 VPS72Q15906 364 aa22.66■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COG3Q96JB2 828 aa22.66■■□□□ 1.22
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