RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.3■■□□□ 1.32
HACE1-211ENST00000521962 USP21Q9UK80 565 aa23.3■■□□□ 1.32
HACE1-211ENST00000521962 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.3■■□□□ 1.32
HACE1-211ENST00000521962 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
HACE1-211ENST00000521962 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.28■■□□□ 1.32
HACE1-211ENST00000521962 ALS2Q96Q42 1657 aa23.28■■□□□ 1.32
HACE1-211ENST00000521962 ACEP12821 1306 aa23.28■■□□□ 1.32
HACE1-211ENST00000521962 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
HACE1-211ENST00000521962 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HACE1-211ENST00000521962 PSME1Q06323 249 aa23.26■■□□□ 1.31
HACE1-211ENST00000521962 CABP1Q9NZU7 370 aa23.26■■□□□ 1.31
HACE1-211ENST00000521962 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.23■■□□□ 1.31
HACE1-211ENST00000521962 ABCA3Q99758 1704 aa23.22■■□□□ 1.31
HACE1-211ENST00000521962 USP6P35125 1406 aa23.22■■□□□ 1.31
HACE1-211ENST00000521962 ARHGEF10O15013 1369 aa23.21■■□□□ 1.31
HACE1-211ENST00000521962 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HACE1-211ENST00000521962 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.21■■□□□ 1.31
HACE1-211ENST00000521962 AKAP12Q02952 1782 aa23.21■■□□□ 1.31
HACE1-211ENST00000521962 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.2■■□□□ 1.3
HACE1-211ENST00000521962 SSH2Q76I76 1423 aa23.2■■□□□ 1.3
HACE1-211ENST00000521962 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
HACE1-211ENST00000521962 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
HACE1-211ENST00000521962 GLI3P10071 1580 aa23.18■■□□□ 1.3
HACE1-211ENST00000521962 SLIT2O94813 1529 aa23.18■■□□□ 1.3
HACE1-211ENST00000521962 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
HACE1-211ENST00000521962 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.16■■□□□ 1.3
HACE1-211ENST00000521962 TMF1P82094 1093 aa23.16■■□□□ 1.3
HACE1-211ENST00000521962 SLC24A1O60721 1099 aa23.15■■□□□ 1.3
HACE1-211ENST00000521962 MYOM1P52179 1685 aa23.15■■□□□ 1.3
HACE1-211ENST00000521962 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.14■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.14■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.14■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 PIK3C2AO00443 1686 aa23.13■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 A0A1W2PP64 1363 aa23.13■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.13■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 CCDC125Q86Z20 511 aa23.12■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 TMC1Q8TDI8 760 aa23.11■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 PLEKHG5O94827 1062 aa23.1■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.1■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.09■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 USP19O94966 1318 aa23.08■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.08■■□□□ 1.29
HACE1-211ENST00000521962 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.08■■□□□ 1.28
HACE1-211ENST00000521962 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.07■■□□□ 1.28
HACE1-211ENST00000521962 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HACE1-211ENST00000521962 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.06■■□□□ 1.28
HACE1-211ENST00000521962 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.06■■□□□ 1.28
HACE1-211ENST00000521962 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.06■■□□□ 1.28
HACE1-211ENST00000521962 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
HACE1-211ENST00000521962 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HACE1-211ENST00000521962 SLIT3O75094 1523 aa23.05■■□□□ 1.28
HACE1-211ENST00000521962 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
HACE1-211ENST00000521962 CDCA8Q53HL2 280 aa23.05■■□□□ 1.28
HACE1-211ENST00000521962 ABTB2Q8N961 1025 aa23.05■■□□□ 1.28
HACE1-211ENST00000521962 USP54Q70EL1 1684 aa23.03■■□□□ 1.28
HACE1-211ENST00000521962 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
HACE1-211ENST00000521962 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.03■■□□□ 1.28
HACE1-211ENST00000521962 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.03■■□□□ 1.28
HACE1-211ENST00000521962 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HACE1-211ENST00000521962 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
HACE1-211ENST00000521962 NLRP6P59044 892 aa22.98■■□□□ 1.27
HACE1-211ENST00000521962 NLRP13Q86W25 1043 aa22.98■■□□□ 1.27
HACE1-211ENST00000521962 NME9Q86XW9 330 aa22.98■■□□□ 1.27
HACE1-211ENST00000521962 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HACE1-211ENST00000521962 USP31Q70CQ4 1352 aa22.98■■□□□ 1.27
HACE1-211ENST00000521962 KIAA0232Q92628 1395 aa22.98■■□□□ 1.27
HACE1-211ENST00000521962 NRAPQ86VF7 1730 aa22.97■■□□□ 1.27
HACE1-211ENST00000521962 VPS72Q15906 364 aa22.97■■□□□ 1.27
HACE1-211ENST00000521962 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.97■■□□□ 1.27
HACE1-211ENST00000521962 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.97■■□□□ 1.27
HACE1-211ENST00000521962 NFAT5O94916 1531 aa22.97■■□□□ 1.27
HACE1-211ENST00000521962 FAM83GA6ND36 823 aa22.96■■□□□ 1.27
HACE1-211ENST00000521962 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HACE1-211ENST00000521962 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.96■■□□□ 1.27
HACE1-211ENST00000521962 LRP5O75197 1615 aa22.95■■□□□ 1.26
HACE1-211ENST00000521962 CPDO75976 1380 aa22.95■■□□□ 1.26
HACE1-211ENST00000521962 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.94■■□□□ 1.26
HACE1-211ENST00000521962 GCP02774 474 aa22.94■■□□□ 1.26
HACE1-211ENST00000521962 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.94■■□□□ 1.26
HACE1-211ENST00000521962 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.94■■□□□ 1.26
HACE1-211ENST00000521962 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.94■■□□□ 1.26
HACE1-211ENST00000521962 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.93■■□□□ 1.26
HACE1-211ENST00000521962 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HACE1-211ENST00000521962 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.92■■□□□ 1.26
HACE1-211ENST00000521962 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.92■■□□□ 1.26
HACE1-211ENST00000521962 CHRNA2Q15822 529 aa22.9■■□□□ 1.26
HACE1-211ENST00000521962 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.88■■□□□ 1.25
HACE1-211ENST00000521962 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.88■■□□□ 1.25
HACE1-211ENST00000521962 CCDC7Q96M83 1385 aa22.88■■□□□ 1.25
HACE1-211ENST00000521962 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.87■■□□□ 1.25
HACE1-211ENST00000521962 COL18A1P39060 1754 aa22.87■■□□□ 1.25
HACE1-211ENST00000521962 BTG4Q9NY30 223 aa22.87■■□□□ 1.25
HACE1-211ENST00000521962 FYB1O15117 783 aa22.86■■□□□ 1.25
HACE1-211ENST00000521962 SOX12O15370 315 aa22.86■■□□□ 1.25
HACE1-211ENST00000521962 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.86■■□□□ 1.25
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