RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-211ENST00000520276 PHF8Q9UPP1 1060 aa12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-211ENST00000520276 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-211ENST00000520276 FOXO3O43524 673 aa12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-211ENST00000520276 FGD1P98174 961 aa12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-211ENST00000520276 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
TRPS1-211ENST00000520276 FSD2A1L4K1 749 aa12.89□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 MYOM2P54296 1465 aa12.89□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 SLAIN2Q9P270 581 aa12.89□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 SIRT1Q96EB6 747 aa12.88□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 PDCL3Q9H2J4 239 aa12.88□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 CABP1Q9NZU7 370 aa12.88□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 USP19O94966 1318 aa12.88□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 PIK3C2GO75747 1445 aa12.87□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 ATAD2Q6PL18 1390 aa12.87□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 ESPNB1AK53 854 aa12.87□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 SEC24BO95487 1268 aa12.86□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 SLIT1O75093 1534 aa12.86□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGAP23Q9P227 1491 aa12.86□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa12.86□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0G2JS52 829 aa12.85□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 ABTB2Q8N961 1025 aa12.85□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 ANTXR1Q9H6X2 564 aa12.85□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 NPHP3Q7Z494 1330 aa12.84□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 MORC1Q86VD1 984 aa12.84□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 RALGAPBQ86X10 1494 aa12.84□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 NLRP6P59044 892 aa12.84□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa12.84□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 ROBO2Q9HCK4 1378 aa12.84□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 NUTM2GQ5VZR2 741 aa12.83□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 KRT28Q7Z3Y7 464 aa12.83□□□□□ -0.35
TRPS1-211ENST00000520276 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa12.83□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa12.83□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 COG3Q96JB2 828 aa12.83□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 PANK3Q9H999 370 aa12.83□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 ALKQ9UM73 1620 aa12.82□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.82□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa12.82□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 UBR1Q8IWV7 1749 aa12.82□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 ORAI2Q96SN7 254 aa12.81□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa12.81□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 NLRP13Q86W25 1043 aa12.81□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 PDE3BQ13370 1112 aa12.81□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa12.8□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 CGNL1Q0VF96 1302 aa12.8□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 CFAP53Q96M91 514 aa12.8□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 MYH16Q9H6N6 1097 aa12.8□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 TPM2P07951 284 aa12.8□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 ARID3AQ99856 593 aa12.79□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 AMPHP49418 695 aa12.79□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 EVA1CP58658 441 aa12.79□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 PDE4CQ08493 712 aa12.79□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 FAM135BQ49AJ0 1406 aa12.79□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 ACEP12821 1306 aa12.78□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 MED14O60244 1454 aa12.78□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 MCM4P33991 863 aa12.78□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 GRPEL1Q9HAV7 217 aa12.78□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 MRE11P49959 708 aa12.77□□□□□ -0.36
TRPS1-211ENST00000520276 BECN1Q14457 450 aa12.77□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 RIPK4P57078 832 aa12.77□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 TRAK2O60296 914 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 IQGAP1P46940 1657 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 ADAMTS2O95450 1211 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 GGNBP2Q9H3C7 697 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 DIP2AQ14689 1571 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D2Q9BYX2 928 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 PRDM11Q9NQV5 511 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 FAM13BQ9NYF5 915 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 CPS1P31327 1500 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 MYO5BQ9ULV0 1848 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 PRDM10Q9NQV6 1147 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 NEURL4Q96JN8 1562 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 PTPRUQ92729 1446 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 PTCH1Q13635 1447 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 NGLY1Q96IV0 654 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-211ENST00000520276 TESK2Q96S53 571 aa12.73□□□□□ -0.37
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