RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515737.5

SH3BP2-228, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,579 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-228ENST00000515737 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-228ENST00000515737 APAF1O14727 1248 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-228ENST00000515737 FBLN1P23142 703 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-228ENST00000515737 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-228ENST00000515737 COG3Q96JB2 828 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-228ENST00000515737 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-228ENST00000515737 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-228ENST00000515737 USP6P35125 1406 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-228ENST00000515737 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-228ENST00000515737 POLKQ9UBT6 870 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-228ENST00000515737 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-228ENST00000515737 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-228ENST00000515737 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-228ENST00000515737 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-228ENST00000515737 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-228ENST00000515737 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-228ENST00000515737 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 RUNDC1Q96C34 613 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 ZNF521Q96K83 1311 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 HSPA2P54652 639 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 C14orf37Q86TY3 774 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 SSH2Q76I76 1423 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 NGEFQ8N5V2 710 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 GOLGA2Q08379 1002 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 NWD1Q149M9 1564 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-228ENST00000515737 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 NEUROD2Q15784 382 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 WWC1Q8IX03 1113 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 SLFN5Q08AF3 891 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-228ENST00000515737 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 USP31Q70CQ4 1352 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 SOX12O15370 315 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 IL13P35225 146 aa22.17■■□□□ 1.14
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SH3BP2-228ENST00000515737 E9PSI1 815 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 NLRP6P59044 892 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 FCHSD2O94868 740 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 PIK3C2AO00443 1686 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 CCDC27Q2M243 656 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 ABTB2Q8N961 1025 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 ORAI2Q96SN7 254 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP2-228ENST00000515737 PSME1Q06323 249 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 HMOX1P09601 288 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 TMEM94Q12767 1356 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 PRKAR2BP31323 418 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 WDR63Q8IWG1 891 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 STRCQ7RTU9 1775 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 FOXO3O43524 673 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 NEFMP07197 916 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 ATF3P18847 181 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 PEAK1Q9H792 1746 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-228ENST00000515737 RIPK4P57078 832 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-228ENST00000515737 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-228ENST00000515737 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-228ENST00000515737 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-228ENST00000515737 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-228ENST00000515737 AMPHP49418 695 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-228ENST00000515737 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.06■■□□□ 1.12
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