RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514903.7

BDP1-205, Transcript of B double prime 1, subunit of RNA polymerase III transcription initiation factor IIIB, human

TSL 5

Gene BDP1, Length 5,511 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BDP1-205	ENST00000514903	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		5	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	RAB23	Q9ULC3	237 aa		5	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		5	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		5	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	EVC2	Q86UK5	1308 aa		5	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903		H7C1D1	291 aa		5	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	RALBP1	Q15311	655 aa		5	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		5	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		5	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	LRRC45	Q96CN5	670 aa		5	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	CABP5	Q9NP86	173 aa		5	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	FANCA	O15360	1455 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	CCDC7	Q96M83	1385 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	SLC4A3	P48751	1232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	CBX1	P83916	185 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	USP21	Q9UK80	565 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	NR1I2	O75469	434 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	SPATA32	Q96LK8	384 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	FCHSD2	O94868	740 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	TRDN	Q13061	729 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	FEZ1	Q99689	392 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	PTPRK	Q15262	1439 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	ABTB2	Q8N961	1025 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	NUTM2F	A1L443	756 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903		M0QZ92	97 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	XBP1	P17861	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	NBPF26	B4DH59	902 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	PDILT	Q8N807	584 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	TRIM29	Q14134	588 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	NYX	Q9GZU5	481 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	ARID3A	Q99856	593 aa		4.96	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		4.96	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		4.96	□□□□□ -1.61
BDP1-205	ENST00000514903	VAMP4	O75379	141 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	TNS4	Q8IZW8	715 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	MYD88	Q99836	296 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903		H0YIN7	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	SEC24B	O95487	1268 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	LDHC	P07864	332 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	NLRP6	P59044	892 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	PTGDR	Q13258	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BDP1-205	ENST00000514903	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms