RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507538.1

RASGEF1B-205, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 691 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-205ENST00000507538 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
RASGEF1B-205ENST00000507538 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.13■■□□□ 1.61
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
RASGEF1B-205ENST00000507538 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.12■■□□□ 1.61
RASGEF1B-205ENST00000507538 SSH2Q76I76 1423 aa25.12■■□□□ 1.61
RASGEF1B-205ENST00000507538 ADAMTS2O95450 1211 aa25.11■■□□□ 1.61
RASGEF1B-205ENST00000507538 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.1■■□□□ 1.61
RASGEF1B-205ENST00000507538 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RASGEF1B-205ENST00000507538 PLEKHG5O94827 1062 aa25.09■■□□□ 1.61
RASGEF1B-205ENST00000507538 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
RASGEF1B-205ENST00000507538 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.08■■□□□ 1.61
RASGEF1B-205ENST00000507538 A0A1W2PP64 1363 aa25.07■■□□□ 1.6
RASGEF1B-205ENST00000507538 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
RASGEF1B-205ENST00000507538 ABTB2Q8N961 1025 aa25.07■■□□□ 1.6
RASGEF1B-205ENST00000507538 AKAP12Q02952 1782 aa25.06■■□□□ 1.6
RASGEF1B-205ENST00000507538 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.06■■□□□ 1.6
RASGEF1B-205ENST00000507538 C8orf37Q96NL8 207 aa25.06■■□□□ 1.6
RASGEF1B-205ENST00000507538 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.06■■□□□ 1.6
RASGEF1B-205ENST00000507538 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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RASGEF1B-205ENST00000507538 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.04■■□□□ 1.6
RASGEF1B-205ENST00000507538 ABCA3Q99758 1704 aa25.03■■□□□ 1.6
RASGEF1B-205ENST00000507538 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.03■■□□□ 1.6
RASGEF1B-205ENST00000507538 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.03■■□□□ 1.6
RASGEF1B-205ENST00000507538 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RASGEF1B-205ENST00000507538 USP19O94966 1318 aa25.02■■□□□ 1.6
RASGEF1B-205ENST00000507538 NGLY1Q96IV0 654 aa25.01■■□□□ 1.59
RASGEF1B-205ENST00000507538 AFF2P51816 1311 aa25.01■■□□□ 1.59
RASGEF1B-205ENST00000507538 NLRP13Q86W25 1043 aa25■■□□□ 1.59
RASGEF1B-205ENST00000507538 POLR3GLQ9BT43 218 aa25■■□□□ 1.59
RASGEF1B-205ENST00000507538 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25■■□□□ 1.59
RASGEF1B-205ENST00000507538 PIK3C2AO00443 1686 aa24.99■■□□□ 1.59
RASGEF1B-205ENST00000507538 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
RASGEF1B-205ENST00000507538 NLRP6P59044 892 aa24.98■■□□□ 1.59
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
RASGEF1B-205ENST00000507538 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
RASGEF1B-205ENST00000507538 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
RASGEF1B-205ENST00000507538 MYOM1P52179 1685 aa24.97■■□□□ 1.59
RASGEF1B-205ENST00000507538 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
RASGEF1B-205ENST00000507538 NME9Q86XW9 330 aa24.95■■□□□ 1.58
RASGEF1B-205ENST00000507538 POTEAQ6S8J7 498 aa24.94■■□□□ 1.58
RASGEF1B-205ENST00000507538 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
RASGEF1B-205ENST00000507538 SLIT3O75094 1523 aa24.93■■□□□ 1.58
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RASGEF1B-205ENST00000507538 USP31Q70CQ4 1352 aa24.93■■□□□ 1.58
RASGEF1B-205ENST00000507538 SLIT2O94813 1529 aa24.92■■□□□ 1.58
RASGEF1B-205ENST00000507538 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.92■■□□□ 1.58
RASGEF1B-205ENST00000507538 GCP02774 474 aa24.92■■□□□ 1.58
RASGEF1B-205ENST00000507538 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.92■■□□□ 1.58
RASGEF1B-205ENST00000507538 KIAA0232Q92628 1395 aa24.92■■□□□ 1.58
RASGEF1B-205ENST00000507538 FAM83GA6ND36 823 aa24.91■■□□□ 1.58
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.91■■□□□ 1.58
RASGEF1B-205ENST00000507538 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.9■■□□□ 1.58
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
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RASGEF1B-205ENST00000507538 CPDO75976 1380 aa24.9■■□□□ 1.58
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RASGEF1B-205ENST00000507538 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.88■■□□□ 1.57
RASGEF1B-205ENST00000507538 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.87■■□□□ 1.57
RASGEF1B-205ENST00000507538 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.87■■□□□ 1.57
RASGEF1B-205ENST00000507538 ILDR2Q71H61 639 aa24.87■■□□□ 1.57
RASGEF1B-205ENST00000507538 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
RASGEF1B-205ENST00000507538 USP54Q70EL1 1684 aa24.86■■□□□ 1.57
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RASGEF1B-205ENST00000507538 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.86■■□□□ 1.57
RASGEF1B-205ENST00000507538 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
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RASGEF1B-205ENST00000507538 CHRNA2Q15822 529 aa24.85■■□□□ 1.57
RASGEF1B-205ENST00000507538 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
RASGEF1B-205ENST00000507538 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.85■■□□□ 1.57
RASGEF1B-205ENST00000507538 CCDC7Q96M83 1385 aa24.84■■□□□ 1.57
RASGEF1B-205ENST00000507538 BTG4Q9NY30 223 aa24.84■■□□□ 1.57
RASGEF1B-205ENST00000507538 NFAT5O94916 1531 aa24.83■■□□□ 1.57
RASGEF1B-205ENST00000507538 SOX12O15370 315 aa24.83■■□□□ 1.57
RASGEF1B-205ENST00000507538 PANK3Q9H999 370 aa24.83■■□□□ 1.57
RASGEF1B-205ENST00000507538 FYB1O15117 783 aa24.82■■□□□ 1.56
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RASGEF1B-205ENST00000507538 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.82■■□□□ 1.56
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RASGEF1B-205ENST00000507538 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.8■■□□□ 1.56
RASGEF1B-205ENST00000507538 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1B-205ENST00000507538 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.79■■□□□ 1.56
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RASGEF1B-205ENST00000507538 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1B-205ENST00000507538 VPS72Q15906 364 aa24.78■■□□□ 1.56
RASGEF1B-205ENST00000507538 NRAPQ86VF7 1730 aa24.78■■□□□ 1.56
RASGEF1B-205ENST00000507538 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.77■■□□□ 1.56
RASGEF1B-205ENST00000507538 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.75■■□□□ 1.55
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RASGEF1B-205ENST00000507538 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.73■■□□□ 1.55
RASGEF1B-205ENST00000507538 STRN4Q9NRL3 753 aa24.73■■□□□ 1.55
RASGEF1B-205ENST00000507538 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
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RASGEF1B-205ENST00000507538 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
RASGEF1B-205ENST00000507538 GLI3P10071 1580 aa24.71■■□□□ 1.55
RASGEF1B-205ENST00000507538 EVA1CP58658 441 aa24.7■■□□□ 1.54
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