RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498594.5

CRAMP1-208, Transcript of cramped chromatin regulator homolog 1, human

TSL 4

Gene CRAMP1, Length 559 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRAMP1-208	ENST00000498594	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	GLI3	P10071	1580 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	ATRN	O75882	1429 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	NUP155	O75694	1391 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	NUTM2F	A1L443	756 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	LRP5	O75197	1615 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	UTRN	P46939	3433 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	PXDN	Q92626	1479 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	USP32	Q8NFA0	1604 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	PTCH1	Q13635	1447 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	NRAP	Q86VF7	1730 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CRAMP1-208	ENST00000498594	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	MYOM2	P54296	1465 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	FOXO3	O43524	673 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	MIER1	Q8N108	512 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	ARID3A	Q99856	593 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	KIF1A	Q12756	1690 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	ROCK1	Q13464	1354 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		5	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	SBF2	Q86WG5	1849 aa		5	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	CHD4	Q14839	1912 aa		5	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		5	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		5	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	STK26	Q9P289	416 aa		5	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	NAIP	Q13075	1403 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	SLIT2	O94813	1529 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	FAM182B	Q5T319	152 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	POTEH	Q6S545	545 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	CCDC125	Q86Z20	511 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	IL27	Q8NEV9	243 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	ALS2	Q96Q42	1657 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	RGPD5	Q99666	1765 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	RGL2	O15211	777 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	RREB1	Q92766	1687 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	HFM1	A2PYH4	1435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	IFFO2	Q5TF58	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRAMP1-208	ENST00000498594		A0A0G2JS52	829 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRAMP1-208	ENST00000498594		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CRAMP1-208	ENST00000498594	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRAMP1-208	ENST00000498594	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CRAMP1-208	ENST00000498594	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CRAMP1-208	ENST00000498594	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CRAMP1-208	ENST00000498594	VPS72	Q15906	364 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRAMP1-208	ENST00000498594	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62

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