RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495146.5

RAB10-204, Transcript of RAB10, member RAS oncogene family, human

TSL 5

Gene RAB10, Length 1,292 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB10-204	ENST00000495146	HRC	P23327	699 aa		33.82	■■■■□ 3
RAB10-204	ENST00000495146	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		33.82	■■■■□ 3
RAB10-204	ENST00000495146	BTG4	Q9NY30	223 aa		33.82	■■■■□ 3
RAB10-204	ENST00000495146	ITSN1	Q15811	1721 aa		33.82	■■■■□ 3
RAB10-204	ENST00000495146	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
RAB10-204	ENST00000495146	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
RAB10-204	ENST00000495146	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		33.76	■■■□□ 2.99
RAB10-204	ENST00000495146	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		33.74	■■■□□ 2.99
RAB10-204	ENST00000495146	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	33.73	■■■□□ 2.99
RAB10-204	ENST00000495146	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	33.73	■■■□□ 2.99
RAB10-204	ENST00000495146	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	33.73	■■■□□ 2.99
RAB10-204	ENST00000495146	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		33.73	■■■□□ 2.99
RAB10-204	ENST00000495146	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		33.73	■■■□□ 2.99
RAB10-204	ENST00000495146		A0A0G2JS52	829 aa		33.72	■■■□□ 2.99
RAB10-204	ENST00000495146	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	33.72	■■■□□ 2.99
RAB10-204	ENST00000495146	MYT1	Q01538	1121 aa		33.72	■■■□□ 2.99
RAB10-204	ENST00000495146	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		33.71	■■■□□ 2.99
RAB10-204	ENST00000495146	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		33.68	■■■□□ 2.98
RAB10-204	ENST00000495146	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	33.68	■■■□□ 2.98
RAB10-204	ENST00000495146	CDK19	Q9BWU1	502 aa		33.67	■■■□□ 2.98
RAB10-204	ENST00000495146	KIAA0232	Q92628	1395 aa		33.67	■■■□□ 2.98
RAB10-204	ENST00000495146	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		33.63	■■■□□ 2.97
RAB10-204	ENST00000495146	FAM182B	Q5T319	152 aa		33.62	■■■□□ 2.97
RAB10-204	ENST00000495146	LRP5	O75197	1615 aa		33.61	■■■□□ 2.97
RAB10-204	ENST00000495146	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		33.6	■■■□□ 2.97
RAB10-204	ENST00000495146	ACE	P12821	1306 aa		33.6	■■■□□ 2.97
RAB10-204	ENST00000495146	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	33.6	■■■□□ 2.97
RAB10-204	ENST00000495146	BAG6	P46379	1132 aa		33.6	■■■□□ 2.97
RAB10-204	ENST00000495146	CHRNA2	Q15822	529 aa		33.6	■■■□□ 2.97
RAB10-204	ENST00000495146	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		33.59	■■■□□ 2.97
RAB10-204	ENST00000495146	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		33.59	■■■□□ 2.97
RAB10-204	ENST00000495146	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		33.59	■■■□□ 2.97
RAB10-204	ENST00000495146	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		33.58	■■■□□ 2.97
RAB10-204	ENST00000495146	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		33.58	■■■□□ 2.97
RAB10-204	ENST00000495146	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		33.57	■■■□□ 2.96
RAB10-204	ENST00000495146	DISP2	A7MBM2	1401 aa		33.56	■■■□□ 2.96
RAB10-204	ENST00000495146	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
RAB10-204	ENST00000495146	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		33.53	■■■□□ 2.96
RAB10-204	ENST00000495146	USP19	O94966	1318 aa		33.53	■■■□□ 2.96
RAB10-204	ENST00000495146	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	33.52	■■■□□ 2.96
RAB10-204	ENST00000495146	STRN4	Q9NRL3	753 aa		33.52	■■■□□ 2.96
RAB10-204	ENST00000495146	SSH2	Q76I76	1423 aa		33.52	■■■□□ 2.96
RAB10-204	ENST00000495146	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.95
RAB10-204	ENST00000495146	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		33.51	■■■□□ 2.95
RAB10-204	ENST00000495146	CPD	O75976	1380 aa		33.48	■■■□□ 2.95
RAB10-204	ENST00000495146	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		33.48	■■■□□ 2.95
RAB10-204	ENST00000495146	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		33.47	■■■□□ 2.95
RAB10-204	ENST00000495146	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
RAB10-204	ENST00000495146	ABTB2	Q8N961	1025 aa		33.45	■■■□□ 2.95
RAB10-204	ENST00000495146	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
RAB10-204	ENST00000495146	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RAB10-204	ENST00000495146	CABP2	Q9NPB3	220 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RAB10-204	ENST00000495146	USP35	Q9P2H5	1018 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RAB10-204	ENST00000495146	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
RAB10-204	ENST00000495146	TRIM37	O94972	964 aa		33.39	■■■□□ 2.94
RAB10-204	ENST00000495146	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
RAB10-204	ENST00000495146	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		33.39	■■■□□ 2.94
RAB10-204	ENST00000495146	USP6	P35125	1406 aa		33.37	■■■□□ 2.93
RAB10-204	ENST00000495146	EVA1C	P58658	441 aa		33.37	■■■□□ 2.93
RAB10-204	ENST00000495146	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		33.37	■■■□□ 2.93
RAB10-204	ENST00000495146	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
RAB10-204	ENST00000495146	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
RAB10-204	ENST00000495146	GC	P02774	474 aa		33.36	■■■□□ 2.93
RAB10-204	ENST00000495146	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
RAB10-204	ENST00000495146	NLRP13	Q86W25	1043 aa		33.36	■■■□□ 2.93
RAB10-204	ENST00000495146	SLIT3	O75094	1523 aa		33.35	■■■□□ 2.93
RAB10-204	ENST00000495146	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		33.34	■■■□□ 2.93
RAB10-204	ENST00000495146	RREB1	Q92766	1687 aa		33.33	■■■□□ 2.93
RAB10-204	ENST00000495146	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		33.33	■■■□□ 2.93
RAB10-204	ENST00000495146	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
RAB10-204	ENST00000495146	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		33.32	■■■□□ 2.92
RAB10-204	ENST00000495146	CABP1	Q9NZU7	370 aa		33.31	■■■□□ 2.92
RAB10-204	ENST00000495146	PIK3C2A	O00443	1686 aa		33.31	■■■□□ 2.92
RAB10-204	ENST00000495146	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		33.3	■■■□□ 2.92
RAB10-204	ENST00000495146	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.29	■■■□□ 2.92
RAB10-204	ENST00000495146	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RAB10-204	ENST00000495146	APBA3	O96018	575 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RAB10-204	ENST00000495146	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
RAB10-204	ENST00000495146	CRB1	P82279	1406 aa		33.27	■■■□□ 2.92
RAB10-204	ENST00000495146	COL18A1	P39060	1754 aa		33.26	■■■□□ 2.91
RAB10-204	ENST00000495146	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		33.25	■■■□□ 2.91
RAB10-204	ENST00000495146	NLRP6	P59044	892 aa		33.24	■■■□□ 2.91
RAB10-204	ENST00000495146	PEAK1	Q9H792	1746 aa		33.24	■■■□□ 2.91
RAB10-204	ENST00000495146	LRRC37A3	O60309	1634 aa		33.23	■■■□□ 2.91
RAB10-204	ENST00000495146	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		33.21	■■■□□ 2.91
RAB10-204	ENST00000495146	EVC2	Q86UK5	1308 aa		33.21	■■■□□ 2.91
RAB10-204	ENST00000495146	AKAP12	Q02952	1782 aa		33.2	■■■□□ 2.91
RAB10-204	ENST00000495146	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		33.19	■■■□□ 2.9
RAB10-204	ENST00000495146	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RAB10-204	ENST00000495146	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
RAB10-204	ENST00000495146	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
RAB10-204	ENST00000495146	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RAB10-204	ENST00000495146	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RAB10-204	ENST00000495146	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RAB10-204	ENST00000495146	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		33.14	■■■□□ 2.9
RAB10-204	ENST00000495146	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RAB10-204	ENST00000495146	SBF2	Q86WG5	1849 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RAB10-204	ENST00000495146	NFAT5	O94916	1531 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RAB10-204	ENST00000495146	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
RAB10-204	ENST00000495146	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		33.11	■■■□□ 2.89

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