RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492338.2

TNS1-218, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNS1, Length 957 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-218ENST00000492338 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TNS1-218ENST00000492338 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TNS1-218ENST00000492338 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-218ENST00000492338 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TNS1-218ENST00000492338 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TNS1-218ENST00000492338 ARHGEF10O15013 1369 aa14.73□□□□□ -0.05
TNS1-218ENST00000492338 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TNS1-218ENST00000492338 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TNS1-218ENST00000492338 KIF1AQ12756 1690 aa14.71□□□□□ -0.05
TNS1-218ENST00000492338 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.71□□□□□ -0.05
TNS1-218ENST00000492338 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.71□□□□□ -0.05
TNS1-218ENST00000492338 ADGRB2O60241 1585 aa14.71□□□□□ -0.05
TNS1-218ENST00000492338 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.71□□□□□ -0.06
TNS1-218ENST00000492338 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.7□□□□□ -0.06
TNS1-218ENST00000492338 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.7□□□□□ -0.06
TNS1-218ENST00000492338 CABP2Q9NPB3 220 aa14.7□□□□□ -0.06
TNS1-218ENST00000492338 PLEKHG3A1L390 1219 aa14.69□□□□□ -0.06
TNS1-218ENST00000492338 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.69□□□□□ -0.06
TNS1-218ENST00000492338 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.69□□□□□ -0.06
TNS1-218ENST00000492338 EVC2Q86UK5 1308 aa14.68□□□□□ -0.06
TNS1-218ENST00000492338 ACEP12821 1306 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-218ENST00000492338 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-218ENST00000492338 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TNS1-218ENST00000492338 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TNS1-218ENST00000492338 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TNS1-218ENST00000492338 CABP1Q9NZU7 370 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-218ENST00000492338 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TNS1-218ENST00000492338 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TNS1-218ENST00000492338 ATP7BP35670 1465 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 USP32Q8NFA0 1604 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 FAM83GA6ND36 823 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 ABTB2Q8N961 1025 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.62□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.62□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 ATRNO75882 1429 aa14.61□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 PRDM11Q9NQV5 511 aa14.61□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 BCL9LQ86UU0 1499 aa14.61□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.61□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 NLRP13Q86W25 1043 aa14.6□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.6□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 VPS72Q15906 364 aa14.59□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 BTG4Q9NY30 223 aa14.59□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 CLSPNQ9HAW4 1339 aa14.59□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.59□□□□□ -0.07
TNS1-218ENST00000492338 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.58□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 SLIT2O94813 1529 aa14.57□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 TMC1Q8TDI8 760 aa14.57□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 RGS12O14924 1447 aa14.57□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 A0A0G2JS52 829 aa14.56□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 NLRP6P59044 892 aa14.56□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 MYT1Q01538 1121 aa14.56□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.56□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 ITSN1Q15811 1721 aa14.55□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 EVA1CP58658 441 aa14.55□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 CFAP44Q96MT7 982 aa14.55□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.55□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.55□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.54□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 CHRNA2Q15822 529 aa14.54□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 SPOCK2Q92563 424 aa14.54□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 KIAA0232Q92628 1395 aa14.54□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 GCP02774 474 aa14.53□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 POLA2Q14181 598 aa14.53□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.53□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 STRN4Q9NRL3 753 aa14.53□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 USP6P35125 1406 aa14.52□□□□□ -0.08
TNS1-218ENST00000492338 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.52□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 KLHL34Q8N239 644 aa14.52□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.51□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 TERF2IPQ9NYB0 399 aa14.51□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 USP19O94966 1318 aa14.5□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.5□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 ALS2Q96Q42 1657 aa14.5□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.5□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 TMF1P82094 1093 aa14.49□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 CCDC125Q86Z20 511 aa14.49□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.49□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.49□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.48□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.48□□□□□ -0.09
TNS1-218ENST00000492338 CDCA8Q53HL2 280 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.7 ms