RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490088.2

HOXD10-202, Transcript of homeobox D10, humanhuman

TSL 2

Gene HOXD10, Length 1,010 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-202ENST00000490088 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.88■■■□□ 2.37
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HOXD10-202ENST00000490088 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
HOXD10-202ENST00000490088 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.84■■■□□ 2.37
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HOXD10-202ENST00000490088 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
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HOXD10-202ENST00000490088 PEAK1Q9H792 1746 aa29.31■■■□□ 2.28
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