RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489517.1

PRRT4-204, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene PRRT4, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-204ENST00000489517 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
PRRT4-204ENST00000489517 USP6P35125 1406 aa36.57■■■■□ 3.44
PRRT4-204ENST00000489517 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
PRRT4-204ENST00000489517 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP36.56■■■■□ 3.44
PRRT4-204ENST00000489517 ERICH6BQ5W0A0 696 aa36.56■■■■□ 3.44
PRRT4-204ENST00000489517 CDCA7LQ96GN5 454 aa36.56■■■■□ 3.44
PRRT4-204ENST00000489517 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
PRRT4-204ENST00000489517 GOLGA2Q08379 1002 aa36.54■■■■□ 3.44
PRRT4-204ENST00000489517 AATKQ6ZMQ8 1374 aa36.53■■■■□ 3.44
PRRT4-204ENST00000489517 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
PRRT4-204ENST00000489517 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa36.53■■■■□ 3.44
PRRT4-204ENST00000489517 PNPLA6Q8IY17 1366 aa36.53■■■■□ 3.44
PRRT4-204ENST00000489517 ZNF521Q96K83 1311 aa36.53■■■■□ 3.44
PRRT4-204ENST00000489517 POLKQ9UBT6 870 aa36.52■■■■□ 3.44
PRRT4-204ENST00000489517 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
PRRT4-204ENST00000489517 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
PRRT4-204ENST00000489517 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.5■■■■□ 3.43
PRRT4-204ENST00000489517 TTC21AQ8NDW8 1320 aa36.5■■■■□ 3.43
PRRT4-204ENST00000489517 NRKQ7Z2Y5 1582 aa36.5■■■■□ 3.43
PRRT4-204ENST00000489517 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
PRRT4-204ENST00000489517 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.5■■■■□ 3.43
PRRT4-204ENST00000489517 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
PRRT4-204ENST00000489517 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.47■■■■□ 3.43
PRRT4-204ENST00000489517 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
PRRT4-204ENST00000489517 RCAN3Q9UKA8 241 aa36.47■■■■□ 3.43
PRRT4-204ENST00000489517 RNF123Q5XPI4 1314 aa36.47■■■■□ 3.43
PRRT4-204ENST00000489517 C14orf37Q86TY3 774 aa36.46■■■■□ 3.43
PRRT4-204ENST00000489517 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.45■■■■□ 3.43
PRRT4-204ENST00000489517 TCP11L2Q8N4U5 519 aa36.44■■■■□ 3.42
PRRT4-204ENST00000489517 NWD1Q149M9 1564 aa36.44■■■■□ 3.42
PRRT4-204ENST00000489517 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
PRRT4-204ENST00000489517 SSH2Q76I76 1423 aa36.43■■■■□ 3.42
PRRT4-204ENST00000489517 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
PRRT4-204ENST00000489517 FBLN1P23142 703 aa36.41■■■■□ 3.42
PRRT4-204ENST00000489517 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
PRRT4-204ENST00000489517 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa36.4■■■■□ 3.42
PRRT4-204ENST00000489517 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.4■■■■□ 3.42
PRRT4-204ENST00000489517 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
PRRT4-204ENST00000489517 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa36.39■■■■□ 3.42
PRRT4-204ENST00000489517 OVOS2Q6IE36 1432 aa36.39■■■■□ 3.42
PRRT4-204ENST00000489517 SLFN5Q08AF3 891 aa36.39■■■■□ 3.42
PRRT4-204ENST00000489517 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
PRRT4-204ENST00000489517 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
PRRT4-204ENST00000489517 E9PSI1 815 aa36.37■■■■□ 3.41
PRRT4-204ENST00000489517 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
PRRT4-204ENST00000489517 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa36.37■■■■□ 3.41
PRRT4-204ENST00000489517 DUSP27Q5VZP5 1158 aa36.37■■■■□ 3.41
PRRT4-204ENST00000489517 WWC1Q8IX03 1113 aa36.37■■■■□ 3.41
PRRT4-204ENST00000489517 NEUROD2Q15784 382 aa36.35■■■■□ 3.41
PRRT4-204ENST00000489517 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.35■■■■□ 3.41
PRRT4-204ENST00000489517 CCDC27Q2M243 656 aa36.35■■■■□ 3.41
PRRT4-204ENST00000489517 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
PRRT4-204ENST00000489517 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
PRRT4-204ENST00000489517 FCHSD2O94868 740 aa36.33■■■■□ 3.41
PRRT4-204ENST00000489517 NEFMP07197 916 aa36.32■■■■□ 3.4
PRRT4-204ENST00000489517 USP31Q70CQ4 1352 aa36.31■■■■□ 3.4
PRRT4-204ENST00000489517 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.31■■■■□ 3.4
PRRT4-204ENST00000489517 RRP1P56182 461 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
PRRT4-204ENST00000489517 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
PRRT4-204ENST00000489517 PLEKHF1Q96S99 279 aa36.31■■■■□ 3.4
PRRT4-204ENST00000489517 PPP4R2Q9NY27 417 aa36.31■■■■□ 3.4
PRRT4-204ENST00000489517 WDR63Q8IWG1 891 aa36.29■■■■□ 3.4
PRRT4-204ENST00000489517 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
PRRT4-204ENST00000489517 IL13P35225 146 aa36.27■■■■□ 3.4
PRRT4-204ENST00000489517 HSPA2P54652 639 aa36.27■■■■□ 3.4
PRRT4-204ENST00000489517 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.27■■■■□ 3.4
PRRT4-204ENST00000489517 NLRP6P59044 892 aa36.23■■■■□ 3.39
PRRT4-204ENST00000489517 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
PRRT4-204ENST00000489517 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.22■■■■□ 3.39
PRRT4-204ENST00000489517 TMPOP42166 694 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
PRRT4-204ENST00000489517 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
PRRT4-204ENST00000489517 PSME1Q06323 249 aa36.2■■■■□ 3.39
PRRT4-204ENST00000489517 RSPH6AQ9H0K4 717 aa36.2■■■■□ 3.39
PRRT4-204ENST00000489517 ABTB2Q8N961 1025 aa36.2■■■■□ 3.38
PRRT4-204ENST00000489517 PRKAR2BP31323 418 aa36.19■■■■□ 3.38
PRRT4-204ENST00000489517 PIK3C2AO00443 1686 aa36.19■■■■□ 3.38
PRRT4-204ENST00000489517 SOX12O15370 315 aa36.18■■■■□ 3.38
PRRT4-204ENST00000489517 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.18■■■■□ 3.38
PRRT4-204ENST00000489517 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.16■■■■□ 3.38
PRRT4-204ENST00000489517 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.16■■■■□ 3.38
PRRT4-204ENST00000489517 MYH16Q9H6N6 1097 aa36.16■■■■□ 3.38
PRRT4-204ENST00000489517 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.15■■■■□ 3.38
PRRT4-204ENST00000489517 HMOX1P09601 288 aa36.15■■■■□ 3.38
PRRT4-204ENST00000489517 RIPK4P57078 832 aa36.14■■■■□ 3.38
PRRT4-204ENST00000489517 SBNO1A3KN83 1393 aa36.12■■■■□ 3.37
PRRT4-204ENST00000489517 TMEM94Q12767 1356 aa36.12■■■■□ 3.37
PRRT4-204ENST00000489517 ATF3P18847 181 aa36.12■■■■□ 3.37
PRRT4-204ENST00000489517 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
PRRT4-204ENST00000489517 MAP3K19Q56UN5 1328 aa36.12■■■■□ 3.37
PRRT4-204ENST00000489517 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
PRRT4-204ENST00000489517 AMPHP49418 695 aa36.1■■■■□ 3.37
PRRT4-204ENST00000489517 FLT4P35916 1363 aa36.1■■■■□ 3.37
PRRT4-204ENST00000489517 NUTM2GQ5VZR2 741 aa36.09■■■■□ 3.37
PRRT4-204ENST00000489517 ORAI2Q96SN7 254 aa36.09■■■■□ 3.37
PRRT4-204ENST00000489517 USP54Q70EL1 1684 aa36.09■■■■□ 3.37
PRRT4-204ENST00000489517 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa36.07■■■■□ 3.37
PRRT4-204ENST00000489517 TRIM35Q9UPQ4 493 aa36.07■■■■□ 3.37
PRRT4-204ENST00000489517 DCCP43146 1447 aa36.07■■■■□ 3.37
PRRT4-204ENST00000489517 KIF24Q5T7B8 1368 aa36.07■■■■□ 3.36
PRRT4-204ENST00000489517 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms