RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PANK1Q8TE04 598 aa20.11■□□□□ 0.81
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.11■□□□□ 0.81
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCC11Q96J66 1382 aa20.11■□□□□ 0.81
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.11■□□□□ 0.81
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.11■□□□□ 0.81
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.1■□□□□ 0.81
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BACH2Q9BYV9 841 aa20.1■□□□□ 0.81
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.09■□□□□ 0.81
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.08■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.08■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 REREQ9P2R6 1566 aa20.08■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.08■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.07■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 E9PSI1 815 aa20.07■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COG6Q9Y2V7 657 aa20.07■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC4A3P48751 1232 aa20.06■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLKQ9UBT6 870 aa20.05■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.05■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.02■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.02■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.02■□□□□ 0.8
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NLRP1Q9C000 1473 aa20.02■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKAR2BP31323 418 aa20.01■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RIPK4P57078 832 aa20.01■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.01■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INSRP06213 1382 aa20.01■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MS4A1P11836 297 aa20■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RLBP1P12271 317 aa20■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EID1Q9Y6B2 187 aa20■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa19.99■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBR1Q8IWV7 1749 aa19.99■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HDGFP51858 240 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM35Q9UPQ4 493 aa19.98■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPS1P31327 1500 aa19.98■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLEKHF1Q96S99 279 aa19.98■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPRUQ92729 1446 aa19.97■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACEP12821 1306 aa19.97■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCTN1Q14203 1278 aa19.97■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BRPF3Q9ULD4 1205 aa19.96■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NSD2O96028 1365 aa19.96■□□□□ 0.79
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM83GA6ND36 823 aa19.95■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COG3Q96JB2 828 aa19.95■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEFMP07197 916 aa19.95■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AEBP1Q8IUX7 1158 aa19.95■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KDM2BQ8NHM5 1336 aa19.94■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP32Q8NFA0 1604 aa19.94■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IQSEC2Q5JU85 1478 aa19.94■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGHDP01880 384 aa19.93■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNA6P17658 529 aa19.93■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C14orf37Q86TY3 774 aa19.93■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NINLQ9Y2I6 1382 aa19.93■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C3P01024 1663 aa19.92■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa19.9■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF20BQ96Q89 1820 aa19.9■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB7CA1YPR0 619 aa19.89■□□□□ 0.78
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.89■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.89■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP7BP35670 1465 aa19.88■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa19.88■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR63Q8IWG1 891 aa19.88■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DLC1Q96QB1 1528 aa19.88■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa19.87■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SSH1Q8WYL5 1049 aa19.87■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM161AQ3B820 660 aa19.86■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.86■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa19.86■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL13P35225 146 aa19.86■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.85■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SULT6B1Q6IMI4 303 aa19.85■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C8orf34Q49A92 452 aa19.85■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPYL6Q8N831 410 aa19.84■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa19.84■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT24Q2M2I5 525 aa19.83■□□□□ 0.77
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms