RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487577.5

TYMP-208, Transcript of thymidine phosphorylase, human

TSL 1 (best)

Gene TYMP, Length 1,751 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TYMP-208	ENST00000487577	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
TYMP-208	ENST00000487577	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		32.81	■■■□□ 2.84
TYMP-208	ENST00000487577	COG3	Q96JB2	828 aa		32.81	■■■□□ 2.84
TYMP-208	ENST00000487577	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		32.8	■■■□□ 2.84
TYMP-208	ENST00000487577	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TYMP-208	ENST00000487577	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
TYMP-208	ENST00000487577	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		32.76	■■■□□ 2.84
TYMP-208	ENST00000487577	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
TYMP-208	ENST00000487577	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TYMP-208	ENST00000487577	NUDC	Q9Y266	331 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TYMP-208	ENST00000487577	PDE3B	Q13370	1112 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TYMP-208	ENST00000487577	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TYMP-208	ENST00000487577	SSH2	Q76I76	1423 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TYMP-208	ENST00000487577	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
TYMP-208	ENST00000487577	POLK	Q9UBT6	870 aa		32.7	■■■□□ 2.82
TYMP-208	ENST00000487577	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		32.7	■■■□□ 2.82
TYMP-208	ENST00000487577	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
TYMP-208	ENST00000487577	NEFL	P07196	543 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TYMP-208	ENST00000487577	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
TYMP-208	ENST00000487577	FBLN1	P23142	703 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TYMP-208	ENST00000487577	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TYMP-208	ENST00000487577	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TYMP-208	ENST00000487577	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
TYMP-208	ENST00000487577	APAF1	O14727	1248 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TYMP-208	ENST00000487577	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
TYMP-208	ENST00000487577	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	32.65	■■■□□ 2.82
TYMP-208	ENST00000487577	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TYMP-208	ENST00000487577	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TYMP-208	ENST00000487577	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
TYMP-208	ENST00000487577	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TYMP-208	ENST00000487577	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
TYMP-208	ENST00000487577	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TYMP-208	ENST00000487577	RUNDC1	Q96C34	613 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TYMP-208	ENST00000487577	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TYMP-208	ENST00000487577	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TYMP-208	ENST00000487577	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TYMP-208	ENST00000487577	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TYMP-208	ENST00000487577	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
TYMP-208	ENST00000487577	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TYMP-208	ENST00000487577	FKBP8	Q14318	412 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TYMP-208	ENST00000487577	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
TYMP-208	ENST00000487577	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TYMP-208	ENST00000487577	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TYMP-208	ENST00000487577	USP31	Q70CQ4	1352 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TYMP-208	ENST00000487577	PIK3C2A	O00443	1686 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TYMP-208	ENST00000487577	ZNF521	Q96K83	1311 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TYMP-208	ENST00000487577	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
TYMP-208	ENST00000487577	ATF3	P18847	181 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TYMP-208	ENST00000487577	PSME1	Q06323	249 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TYMP-208	ENST00000487577	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TYMP-208	ENST00000487577	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.51	■■■□□ 2.8
TYMP-208	ENST00000487577	NLRP6	P59044	892 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TYMP-208	ENST00000487577	GOLGA2	Q08379	1002 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TYMP-208	ENST00000487577	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TYMP-208	ENST00000487577	ABTB2	Q8N961	1025 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TYMP-208	ENST00000487577	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
TYMP-208	ENST00000487577	SOX12	O15370	315 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TYMP-208	ENST00000487577	DCC	P43146	1447 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TYMP-208	ENST00000487577	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TYMP-208	ENST00000487577	IL13	P35225	146 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TYMP-208	ENST00000487577	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TYMP-208	ENST00000487577	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
TYMP-208	ENST00000487577	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TYMP-208	ENST00000487577	USP54	Q70EL1	1684 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TYMP-208	ENST00000487577	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		32.45	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.45	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	KIF1A	Q12756	1690 aa		32.45	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	FCHSD2	O94868	740 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	MSH6	P52701	1360 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	FOXO3	O43524	673 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	MST1R	Q04912	1400 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	SLFN5	Q08AF3	891 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	PEAK1	Q9H792	1746 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TYMP-208	ENST00000487577	NEFM	P07197	916 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577		E9PSI1	815 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	SBNO1	A3KN83	1393 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	HMOX1	P09601	288 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	PRKAR2B	P31323	418 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	AMPH	P49418	695 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	FLT4	P35916	1363 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TYMP-208	ENST00000487577	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77

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