RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484988.2

SGIP1-211, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene SGIP1, Length 440 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-211ENST00000484988 CTHP32929 405 aa6.75□□□□□ -1.33
SGIP1-211ENST00000484988 CYP4X1Q8N118 509 aa6.75□□□□□ -1.33
SGIP1-211ENST00000484988 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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SGIP1-211ENST00000484988 MAP10Q9P2G4 905 aa6.75□□□□□ -1.33
SGIP1-211ENST00000484988 FAM187AA6NFU0 413 aa6.74□□□□□ -1.33
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SGIP1-211ENST00000484988 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.63□□□□□ -1.35
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SGIP1-211ENST00000484988 ADAM32Q8TC27 787 aa6.55□□□□□ -1.36
SGIP1-211ENST00000484988 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SGIP1-211ENST00000484988 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
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SGIP1-211ENST00000484988 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SGIP1-211ENST00000484988 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SGIP1-211ENST00000484988 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SGIP1-211ENST00000484988 FSHRP23945 695 aa6.52□□□□□ -1.37
SGIP1-211ENST00000484988 ITPKCQ96DU7 683 aa6.52□□□□□ -1.37
SGIP1-211ENST00000484988 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.52□□□□□ -1.37
SGIP1-211ENST00000484988 TRIM47Q96LD4 638 aa6.52□□□□□ -1.37
SGIP1-211ENST00000484988 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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