RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484918.1

MRPL23-209, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, human

TSL 5

Gene MRPL23, Length 232 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL23-209	ENST00000484918	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MRPL23-209	ENST00000484918	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MRPL23-209	ENST00000484918	TSPY4	P0CV99	314 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MRPL23-209	ENST00000484918	TSPY10	P0CW01	314 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MRPL23-209	ENST00000484918	PROM2	Q8N271	834 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MRPL23-209	ENST00000484918	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MRPL23-209	ENST00000484918	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MRPL23-209	ENST00000484918	BTG4	Q9NY30	223 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MRPL23-209	ENST00000484918	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MRPL23-209	ENST00000484918	SLC15A2	Q16348	729 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MRPL23-209	ENST00000484918	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
MRPL23-209	ENST00000484918	PEAK1	Q9H792	1746 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MRPL23-209	ENST00000484918	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
MRPL23-209	ENST00000484918	USP19	O94966	1318 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MRPL23-209	ENST00000484918	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		10.58	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		10.58	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		10.58	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		10.58	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	STK32B	Q9NY57	414 aa		10.57	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		10.57	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		10.57	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	KANK1	Q14678	1352 aa		10.56	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	KLHL34	Q8N239	644 aa		10.56	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	CEP162	Q5TB80	1403 aa		10.56	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		10.55	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	KIF1A	Q12756	1690 aa		10.55	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	10.55	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	ABHD8	Q96I13	439 aa		10.55	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		10.54	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	TECPR2	O15040	1411 aa		10.54	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	PAPPA	Q13219	1627 aa		10.54	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		10.54	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	PDE3B	Q13370	1112 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MRPL23-209	ENST00000484918	EEA1	Q15075	1411 aa		10.52	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	PLEKHG5	O94827	1062 aa		10.52	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		10.52	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	KIF15	Q9NS87	1388 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	FSTL1	Q12841	308 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		10.5	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	TXNRD1	Q16881	649 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	SBNO1	A3KN83	1393 aa		10.49	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	FOXN1	O15353	648 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	ARHGEF10	O15013	1369 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	HFM1	A2PYH4	1435 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
MRPL23-209	ENST00000484918	ATP7B	P35670	1465 aa		10.46	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		10.46	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	POLD1	P28340	1107 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	ALS2	Q96Q42	1657 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	NAIP	Q13075	1403 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	NUTM2F	A1L443	756 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF827	Q17R98	1081 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	USP35	Q9P2H5	1018 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	LRRC37A3	O60309	1634 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	PSME1	Q06323	249 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918		E9PCH4	1651 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRPL23-209	ENST00000484918	BCL9	O00512	1426 aa		10.4	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		10.4	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	SSH2	Q76I76	1423 aa		10.4	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	STRN4	Q9NRL3	753 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	AKAP12	Q02952	1782 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	DLL1	O00548	723 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	LBX1	P52954	281 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	KIAA0232	Q92628	1395 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	IFT172	Q9UG01	1749 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	CHRNA2	Q15822	529 aa		10.34	□□□□□ -0.75

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