RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483015.1

MIB2-211, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 3

Gene MIB2, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-211ENST00000483015 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
MIB2-211ENST00000483015 CCDC125Q86Z20 511 aa34.79■■■■□ 3.16
MIB2-211ENST00000483015 PLEKHG3A1L390 1219 aa34.78■■■■□ 3.16
MIB2-211ENST00000483015 UNC5CLQ8IV45 518 aa34.78■■■■□ 3.16
MIB2-211ENST00000483015 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
MIB2-211ENST00000483015 SLIT2O94813 1529 aa34.76■■■■□ 3.15
MIB2-211ENST00000483015 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.74■■■■□ 3.15
MIB2-211ENST00000483015 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
MIB2-211ENST00000483015 LMOD2Q6P5Q4 547 aa34.74■■■■□ 3.15
MIB2-211ENST00000483015 CABP2Q9NPB3 220 aa34.74■■■■□ 3.15
MIB2-211ENST00000483015 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
MIB2-211ENST00000483015 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
MIB2-211ENST00000483015 ACEP12821 1306 aa34.71■■■■□ 3.15
MIB2-211ENST00000483015 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
MIB2-211ENST00000483015 ALS2Q96Q42 1657 aa34.66■■■■□ 3.14
MIB2-211ENST00000483015 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
MIB2-211ENST00000483015 VPS72Q15906 364 aa34.61■■■■□ 3.13
MIB2-211ENST00000483015 CABP1Q9NZU7 370 aa34.61■■■■□ 3.13
MIB2-211ENST00000483015 NWD2Q9ULI1 1742 aa34.61■■■■□ 3.13
MIB2-211ENST00000483015 EP400Q96L91 3159 aa34.6■■■■□ 3.13
MIB2-211ENST00000483015 GLI3P10071 1580 aa34.59■■■■□ 3.13
MIB2-211ENST00000483015 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
MIB2-211ENST00000483015 CABLES1Q8TDN4 633 aa34.58■■■■□ 3.13
MIB2-211ENST00000483015 ZRANB1Q9UGI0 708 aa34.58■■■■□ 3.13
MIB2-211ENST00000483015 USP47Q96K76 1375 aa34.58■■■■□ 3.13
MIB2-211ENST00000483015 ABCA3Q99758 1704 aa34.56■■■■□ 3.12
MIB2-211ENST00000483015 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa34.56■■■■□ 3.12
MIB2-211ENST00000483015 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
MIB2-211ENST00000483015 USP6P35125 1406 aa34.55■■■■□ 3.12
MIB2-211ENST00000483015 PLCH1Q4KWH8 1693 aa34.52■■■■□ 3.12
MIB2-211ENST00000483015 ABTB2Q8N961 1025 aa34.52■■■■□ 3.12
MIB2-211ENST00000483015 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
MIB2-211ENST00000483015 NINLQ9Y2I6 1382 aa34.51■■■■□ 3.12
MIB2-211ENST00000483015 FAM83GA6ND36 823 aa34.5■■■■□ 3.11
MIB2-211ENST00000483015 SEPT12Q8IYM1 358 aa34.5■■■■□ 3.11
MIB2-211ENST00000483015 PLEKHG5O94827 1062 aa34.49■■■■□ 3.11
MIB2-211ENST00000483015 NLRP13Q86W25 1043 aa34.49■■■■□ 3.11
MIB2-211ENST00000483015 TESK2Q96S53 571 aa34.49■■■■□ 3.11
MIB2-211ENST00000483015 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
MIB2-211ENST00000483015 TMF1P82094 1093 aa34.48■■■■□ 3.11
MIB2-211ENST00000483015 CDCA8Q53HL2 280 aa34.48■■■■□ 3.11
MIB2-211ENST00000483015 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
MIB2-211ENST00000483015 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa34.44■■■■□ 3.1
MIB2-211ENST00000483015 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
MIB2-211ENST00000483015 TTC21AQ8NDW8 1320 aa34.44■■■■□ 3.1
MIB2-211ENST00000483015 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
MIB2-211ENST00000483015 AKAP12Q02952 1782 aa34.44■■■■□ 3.1
MIB2-211ENST00000483015 BRWD3Q6RI45 1802 aa34.44■■■■□ 3.1
MIB2-211ENST00000483015 TMC1Q8TDI8 760 aa34.43■■■■□ 3.1
MIB2-211ENST00000483015 TERF2IPQ9NYB0 399 aa34.43■■■■□ 3.1
MIB2-211ENST00000483015 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
MIB2-211ENST00000483015 KRT27Q7Z3Y8 459 aa34.42■■■■□ 3.1
MIB2-211ENST00000483015 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
MIB2-211ENST00000483015 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
MIB2-211ENST00000483015 SSH2Q76I76 1423 aa34.41■■■■□ 3.1
MIB2-211ENST00000483015 USP19O94966 1318 aa34.4■■■■□ 3.1
MIB2-211ENST00000483015 PRDM11Q9NQV5 511 aa34.4■■■■□ 3.1
MIB2-211ENST00000483015 BTG4Q9NY30 223 aa34.4■■■■□ 3.1
MIB2-211ENST00000483015 NUTM2GQ5VZR2 741 aa34.38■■■■□ 3.09
MIB2-211ENST00000483015 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa34.37■■■■□ 3.09
MIB2-211ENST00000483015 NLRP6P59044 892 aa34.37■■■■□ 3.09
MIB2-211ENST00000483015 NRAPQ86VF7 1730 aa34.36■■■■□ 3.09
MIB2-211ENST00000483015 MON2Q7Z3U7 1717 aa34.35■■■■□ 3.09
MIB2-211ENST00000483015 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa34.34■■■■□ 3.09
MIB2-211ENST00000483015 NRKQ7Z2Y5 1582 aa34.33■■■■□ 3.09
MIB2-211ENST00000483015 CPDO75976 1380 aa34.33■■■■□ 3.09
MIB2-211ENST00000483015 KIAA0232Q92628 1395 aa34.33■■■■□ 3.09
MIB2-211ENST00000483015 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.32■■■■□ 3.08
MIB2-211ENST00000483015 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa34.32■■■■□ 3.08
MIB2-211ENST00000483015 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
MIB2-211ENST00000483015 A0A0G2JS52 829 aa34.31■■■■□ 3.08
MIB2-211ENST00000483015 GCP02774 474 aa34.31■■■■□ 3.08
MIB2-211ENST00000483015 MYT1Q01538 1121 aa34.31■■■■□ 3.08
MIB2-211ENST00000483015 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
MIB2-211ENST00000483015 KCNH5Q8NCM2 988 aa34.3■■■■□ 3.08
MIB2-211ENST00000483015 PIK3C2AO00443 1686 aa34.3■■■■□ 3.08
MIB2-211ENST00000483015 CD163L1Q9NR16 1453 aa34.29■■■■□ 3.08
MIB2-211ENST00000483015 SLIT3O75094 1523 aa34.29■■■■□ 3.08
MIB2-211ENST00000483015 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa34.29■■■■□ 3.08
MIB2-211ENST00000483015 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa34.29■■■■□ 3.08
MIB2-211ENST00000483015 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
MIB2-211ENST00000483015 A0A1W2PP64 1363 aa34.27■■■■□ 3.08
MIB2-211ENST00000483015 DEFB132Q7Z7B7 95 aa34.25■■■■□ 3.07
MIB2-211ENST00000483015 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa34.24■■■■□ 3.07
MIB2-211ENST00000483015 BAG6P46379 1132 aa34.24■■■■□ 3.07
MIB2-211ENST00000483015 USP31Q70CQ4 1352 aa34.23■■■■□ 3.07
MIB2-211ENST00000483015 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP34.21■■■■□ 3.07
MIB2-211ENST00000483015 CHRNA2Q15822 529 aa34.19■■■■□ 3.06
MIB2-211ENST00000483015 USP54Q70EL1 1684 aa34.19■■■■□ 3.06
MIB2-211ENST00000483015 EVA1CP58658 441 aa34.17■■■■□ 3.06
MIB2-211ENST00000483015 AATKQ6ZMQ8 1374 aa34.16■■■■□ 3.06
MIB2-211ENST00000483015 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa34.16■■■■□ 3.06
MIB2-211ENST00000483015 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa34.15■■■■□ 3.06
MIB2-211ENST00000483015 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
MIB2-211ENST00000483015 LMO7Q8WWI1 1683 aa34.13■■■■□ 3.05
MIB2-211ENST00000483015 NME9Q86XW9 330 aa34.12■■■■□ 3.05
MIB2-211ENST00000483015 ABCC6O95255 1503 aa34.12■■■■□ 3.05
MIB2-211ENST00000483015 RGPD1P0DJD0 1748 aa34.12■■■■□ 3.05
MIB2-211ENST00000483015 STRN4Q9NRL3 753 aa34.11■■■■□ 3.05
MIB2-211ENST00000483015 ZBTB7CA1YPR0 619 aa34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.8 ms