RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482902.5

SSR4-209, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 2,409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-209ENST00000482902 PRAM1Q96QH2 718 aa22.91■■□□□ 1.26
SSR4-209ENST00000482902 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.91■■□□□ 1.26
SSR4-209ENST00000482902 FSD2A1L4K1 749 aa22.91■■□□□ 1.26
SSR4-209ENST00000482902 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
SSR4-209ENST00000482902 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SSR4-209ENST00000482902 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.91■■□□□ 1.26
SSR4-209ENST00000482902 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SSR4-209ENST00000482902 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.91■■□□□ 1.26
SSR4-209ENST00000482902 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.91■■□□□ 1.26
SSR4-209ENST00000482902 PTPRMP28827 1452 aa22.9■■□□□ 1.26
SSR4-209ENST00000482902 FYB1O15117 783 aa22.9■■□□□ 1.26
SSR4-209ENST00000482902 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SSR4-209ENST00000482902 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SSR4-209ENST00000482902 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.9■■□□□ 1.26
SSR4-209ENST00000482902 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.88■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 RICTORQ6R327 1708 aa22.87■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 CLCN1P35523 988 aa22.87■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.87■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.86■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.86■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.86■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.86■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.86■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.85■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 ZMYM3Q14202 1370 aa22.85■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.85■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 PANK2Q9BZ23 570 aa22.84■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 MED14O60244 1454 aa22.84■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.84■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 ARXQ96QS3 562 aa22.83■■□□□ 1.25
SSR4-209ENST00000482902 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.82■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 CDK19Q9BWU1 502 aa22.82■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 TRIM27P14373 513 aa22.81■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 RIPK4P57078 832 aa22.81■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 IL16Q14005 1332 aa22.81■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 MCM4P33991 863 aa22.81■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 CABP1Q9NZU7 370 aa22.8■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.78■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.78■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.78■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.78■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.78■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.78■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 ALKQ9UM73 1620 aa22.77■■□□□ 1.24
SSR4-209ENST00000482902 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.77■■□□□ 1.23
SSR4-209ENST00000482902 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SSR4-209ENST00000482902 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SSR4-209ENST00000482902 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SSR4-209ENST00000482902 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SSR4-209ENST00000482902 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SSR4-209ENST00000482902 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.73■■□□□ 1.23
SSR4-209ENST00000482902 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
SSR4-209ENST00000482902 FCHSD2O94868 740 aa22.72■■□□□ 1.23
SSR4-209ENST00000482902 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.72■■□□□ 1.23
SSR4-209ENST00000482902 ZMYND15Q9H091 742 aa22.72■■□□□ 1.23
SSR4-209ENST00000482902 TRAK2O60296 914 aa22.71■■□□□ 1.23
SSR4-209ENST00000482902 MRE11P49959 708 aa22.71■■□□□ 1.23
SSR4-209ENST00000482902 KIF16BQ96L93 1317 aa22.71■■□□□ 1.23
SSR4-209ENST00000482902 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 FBLN1P23142 703 aa22.7■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.7■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.7■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 PRKAR2BP31323 418 aa22.7■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.69■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 POLKQ9UBT6 870 aa22.69■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.68■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.68■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.68■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.68■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 SMC5Q8IY18 1101 aa22.67■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.66■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.66■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 ERBB4Q15303 1308 aa22.66■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 ATP7BP35670 1465 aa22.65■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.65■■□□□ 1.22
SSR4-209ENST00000482902 ESPNB1AK53 854 aa22.64■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 DLC1Q96QB1 1528 aa22.64■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 HMOX1P09601 288 aa22.63■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.63■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.63■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.63■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 NFE2L2Q16236 605 aa22.62■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.62■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.62■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.62■■□□□ 1.21
SSR4-209ENST00000482902 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
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