RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481414.5

KCNS3-205, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, human

TSL 4

Gene KCNS3, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNS3-205	ENST00000481414	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	33.76	■■■□□ 2.99
KCNS3-205	ENST00000481414	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		33.75	■■■□□ 2.99
KCNS3-205	ENST00000481414	MYOM1	P52179	1685 aa		33.74	■■■□□ 2.99
KCNS3-205	ENST00000481414	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	33.73	■■■□□ 2.99
KCNS3-205	ENST00000481414	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		33.72	■■■□□ 2.99
KCNS3-205	ENST00000481414	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		33.71	■■■□□ 2.99
KCNS3-205	ENST00000481414	ARHGEF10	O15013	1369 aa		33.71	■■■□□ 2.99
KCNS3-205	ENST00000481414	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		33.7	■■■□□ 2.98
KCNS3-205	ENST00000481414	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	33.7	■■■□□ 2.98
KCNS3-205	ENST00000481414	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		33.68	■■■□□ 2.98
KCNS3-205	ENST00000481414	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		33.67	■■■□□ 2.98
KCNS3-205	ENST00000481414	SHPRH	Q149N8	1683 aa		33.66	■■■□□ 2.98
KCNS3-205	ENST00000481414	ALS2	Q96Q42	1657 aa		33.66	■■■□□ 2.98
KCNS3-205	ENST00000481414	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		33.64	■■■□□ 2.98
KCNS3-205	ENST00000481414	ABTB2	Q8N961	1025 aa		33.64	■■■□□ 2.98
KCNS3-205	ENST00000481414	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		33.64	■■■□□ 2.98
KCNS3-205	ENST00000481414	PANK3	Q9H999	370 aa		33.64	■■■□□ 2.98
KCNS3-205	ENST00000481414	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		33.63	■■■□□ 2.97
KCNS3-205	ENST00000481414	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
KCNS3-205	ENST00000481414	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	33.61	■■■□□ 2.97
KCNS3-205	ENST00000481414	NLRP13	Q86W25	1043 aa		33.58	■■■□□ 2.97
KCNS3-205	ENST00000481414	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		33.57	■■■□□ 2.96
KCNS3-205	ENST00000481414	NLRP6	P59044	892 aa		33.56	■■■□□ 2.96
KCNS3-205	ENST00000481414	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		33.56	■■■□□ 2.96
KCNS3-205	ENST00000481414	NME9	Q86XW9	330 aa		33.55	■■■□□ 2.96
KCNS3-205	ENST00000481414	USP31	Q70CQ4	1352 aa		33.55	■■■□□ 2.96
KCNS3-205	ENST00000481414	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	33.54	■■■□□ 2.96
KCNS3-205	ENST00000481414	PIK3C2A	O00443	1686 aa		33.54	■■■□□ 2.96
KCNS3-205	ENST00000481414	USP19	O94966	1318 aa		33.53	■■■□□ 2.96
KCNS3-205	ENST00000481414	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		33.52	■■■□□ 2.96
KCNS3-205	ENST00000481414	FYB1	O15117	783 aa		33.51	■■■□□ 2.95
KCNS3-205	ENST00000481414	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
KCNS3-205	ENST00000481414	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
KCNS3-205	ENST00000481414	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
KCNS3-205	ENST00000481414	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		33.5	■■■□□ 2.95
KCNS3-205	ENST00000481414	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
KCNS3-205	ENST00000481414	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		33.48	■■■□□ 2.95
KCNS3-205	ENST00000481414	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		33.48	■■■□□ 2.95
KCNS3-205	ENST00000481414	PLEKHG5	O94827	1062 aa		33.46	■■■□□ 2.95
KCNS3-205	ENST00000481414	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
KCNS3-205	ENST00000481414	LRP6	O75581	1613 aa		33.46	■■■□□ 2.95
KCNS3-205	ENST00000481414	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		33.45	■■■□□ 2.94
KCNS3-205	ENST00000481414	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		33.45	■■■□□ 2.94
KCNS3-205	ENST00000481414	GC	P02774	474 aa		33.44	■■■□□ 2.94
KCNS3-205	ENST00000481414	COG3	Q96JB2	828 aa		33.44	■■■□□ 2.94
KCNS3-205	ENST00000481414	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		33.44	■■■□□ 2.94
KCNS3-205	ENST00000481414	USP54	Q70EL1	1684 aa		33.44	■■■□□ 2.94
KCNS3-205	ENST00000481414	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		33.44	■■■□□ 2.94
KCNS3-205	ENST00000481414	SLIT3	O75094	1523 aa		33.43	■■■□□ 2.94
KCNS3-205	ENST00000481414	ABCA3	Q99758	1704 aa		33.42	■■■□□ 2.94
KCNS3-205	ENST00000481414	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		33.41	■■■□□ 2.94
KCNS3-205	ENST00000481414	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
KCNS3-205	ENST00000481414	ADAMTS2	O95450	1211 aa		33.4	■■■□□ 2.94
KCNS3-205	ENST00000481414	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
KCNS3-205	ENST00000481414	NSD2	O96028	1365 aa		33.39	■■■□□ 2.94
KCNS3-205	ENST00000481414	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
KCNS3-205	ENST00000481414	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
KCNS3-205	ENST00000481414	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		33.37	■■■□□ 2.93
KCNS3-205	ENST00000481414	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
KCNS3-205	ENST00000481414	CPD	O75976	1380 aa		33.34	■■■□□ 2.93
KCNS3-205	ENST00000481414	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		33.34	■■■□□ 2.93
KCNS3-205	ENST00000481414	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
KCNS3-205	ENST00000481414	NFAT5	O94916	1531 aa		33.31	■■■□□ 2.92
KCNS3-205	ENST00000481414	KIAA0232	Q92628	1395 aa		33.31	■■■□□ 2.92
KCNS3-205	ENST00000481414	FAM83G	A6ND36	823 aa		33.3	■■■□□ 2.92
KCNS3-205	ENST00000481414	SOX12	O15370	315 aa		33.3	■■■□□ 2.92
KCNS3-205	ENST00000481414	C8orf37	Q96NL8	207 aa		33.3	■■■□□ 2.92
KCNS3-205	ENST00000481414	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		33.3	■■■□□ 2.92
KCNS3-205	ENST00000481414	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		33.29	■■■□□ 2.92
KCNS3-205	ENST00000481414	NGLY1	Q96IV0	654 aa		33.28	■■■□□ 2.92
KCNS3-205	ENST00000481414	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
KCNS3-205	ENST00000481414	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.25	■■■□□ 2.91
KCNS3-205	ENST00000481414	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		33.25	■■■□□ 2.91
KCNS3-205	ENST00000481414	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
KCNS3-205	ENST00000481414	CHRNA2	Q15822	529 aa		33.23	■■■□□ 2.91
KCNS3-205	ENST00000481414	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		33.22	■■■□□ 2.91
KCNS3-205	ENST00000481414	FBLN1	P23142	703 aa		33.21	■■■□□ 2.91
KCNS3-205	ENST00000481414	SLIT2	O94813	1529 aa		33.21	■■■□□ 2.91
KCNS3-205	ENST00000481414	AFF2	P51816	1311 aa		33.21	■■■□□ 2.91
KCNS3-205	ENST00000481414	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
KCNS3-205	ENST00000481414	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.19	■■■□□ 2.9
KCNS3-205	ENST00000481414	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		33.18	■■■□□ 2.9
KCNS3-205	ENST00000481414	BTG4	Q9NY30	223 aa		33.17	■■■□□ 2.9
KCNS3-205	ENST00000481414	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
KCNS3-205	ENST00000481414	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
KCNS3-205	ENST00000481414	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
KCNS3-205	ENST00000481414	ABCC6	O95255	1503 aa		33.15	■■■□□ 2.9
KCNS3-205	ENST00000481414	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		33.15	■■■□□ 2.9
KCNS3-205	ENST00000481414	USP21	Q9UK80	565 aa		33.15	■■■□□ 2.9
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
KCNS3-205	ENST00000481414	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		33.14	■■■□□ 2.9
KCNS3-205	ENST00000481414	IP6K1	Q92551	441 aa		33.14	■■■□□ 2.9
KCNS3-205	ENST00000481414	COL18A1	P39060	1754 aa		33.14	■■■□□ 2.9
KCNS3-205	ENST00000481414	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		33.13	■■■□□ 2.89
KCNS3-205	ENST00000481414	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		33.13	■■■□□ 2.89
KCNS3-205	ENST00000481414	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		33.13	■■■□□ 2.89
KCNS3-205	ENST00000481414	AMPH	P49418	695 aa		33.12	■■■□□ 2.89
KCNS3-205	ENST00000481414	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
KCNS3-205	ENST00000481414	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.12	■■■□□ 2.89

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