RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480099.1

PKDCC-206, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 787 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-206ENST00000480099 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PKDCC-206ENST00000480099 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.44■■□□□ 1.18
PKDCC-206ENST00000480099 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.44■■□□□ 1.18
PKDCC-206ENST00000480099 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.43■■□□□ 1.18
PKDCC-206ENST00000480099 SBNO1A3KN83 1393 aa22.42■■□□□ 1.18
PKDCC-206ENST00000480099 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PKDCC-206ENST00000480099 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.41■■□□□ 1.18
PKDCC-206ENST00000480099 PIK3C2AO00443 1686 aa22.41■■□□□ 1.18
PKDCC-206ENST00000480099 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PKDCC-206ENST00000480099 ABCA3Q99758 1704 aa22.4■■□□□ 1.18
PKDCC-206ENST00000480099 JCADQ9P266 1359 aa22.4■■□□□ 1.18
PKDCC-206ENST00000480099 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.39■■□□□ 1.18
PKDCC-206ENST00000480099 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PKDCC-206ENST00000480099 ARHGEF10O15013 1369 aa22.38■■□□□ 1.17
PKDCC-206ENST00000480099 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-206ENST00000480099 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-206ENST00000480099 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-206ENST00000480099 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-206ENST00000480099 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-206ENST00000480099 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-206ENST00000480099 PLEKHG5O94827 1062 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-206ENST00000480099 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-206ENST00000480099 ABTB2Q8N961 1025 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-206ENST00000480099 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-206ENST00000480099 SSH2Q76I76 1423 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-206ENST00000480099 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-206ENST00000480099 USP54Q70EL1 1684 aa22.33■■□□□ 1.17
PKDCC-206ENST00000480099 PANK3Q9H999 370 aa22.33■■□□□ 1.17
PKDCC-206ENST00000480099 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
PKDCC-206ENST00000480099 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PKDCC-206ENST00000480099 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.32■■□□□ 1.16
PKDCC-206ENST00000480099 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PKDCC-206ENST00000480099 SOCS7O14512 581 aa22.3■■□□□ 1.16
PKDCC-206ENST00000480099 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.3■■□□□ 1.16
PKDCC-206ENST00000480099 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PKDCC-206ENST00000480099 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PKDCC-206ENST00000480099 NLRP6P59044 892 aa22.29■■□□□ 1.16
PKDCC-206ENST00000480099 NLRP13Q86W25 1043 aa22.29■■□□□ 1.16
PKDCC-206ENST00000480099 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PKDCC-206ENST00000480099 NME9Q86XW9 330 aa22.27■■□□□ 1.16
PKDCC-206ENST00000480099 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.27■■□□□ 1.16
PKDCC-206ENST00000480099 LTN1O94822 1766 aa22.27■■□□□ 1.16
PKDCC-206ENST00000480099 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.26■■□□□ 1.15
PKDCC-206ENST00000480099 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.26■■□□□ 1.15
PKDCC-206ENST00000480099 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.25■■□□□ 1.15
PKDCC-206ENST00000480099 SLIT3O75094 1523 aa22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-206ENST00000480099 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-206ENST00000480099 COG3Q96JB2 828 aa22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-206ENST00000480099 LRP6O75581 1613 aa22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-206ENST00000480099 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PKDCC-206ENST00000480099 USP31Q70CQ4 1352 aa22.22■■□□□ 1.15
PKDCC-206ENST00000480099 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-206ENST00000480099 ADAMTS2O95450 1211 aa22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-206ENST00000480099 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-206ENST00000480099 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-206ENST00000480099 USP19O94966 1318 aa22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-206ENST00000480099 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-206ENST00000480099 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-206ENST00000480099 SOX12O15370 315 aa22.2■■□□□ 1.14
PKDCC-206ENST00000480099 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PKDCC-206ENST00000480099 FYB1O15117 783 aa22.19■■□□□ 1.14
PKDCC-206ENST00000480099 ILDR2Q71H61 639 aa22.19■■□□□ 1.14
PKDCC-206ENST00000480099 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PKDCC-206ENST00000480099 RGPD5Q99666 1765 aa22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-206ENST00000480099 NSD2O96028 1365 aa22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-206ENST00000480099 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-206ENST00000480099 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-206ENST00000480099 GCP02774 474 aa22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-206ENST00000480099 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-206ENST00000480099 NFAT5O94916 1531 aa22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-206ENST00000480099 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PKDCC-206ENST00000480099 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-206ENST00000480099 C8orf37Q96NL8 207 aa22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-206ENST00000480099 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PKDCC-206ENST00000480099 KIAA0232Q92628 1395 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-206ENST00000480099 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-206ENST00000480099 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-206ENST00000480099 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-206ENST00000480099 MORC1Q86VD1 984 aa22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-206ENST00000480099 NGLY1Q96IV0 654 aa22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-206ENST00000480099 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-206ENST00000480099 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PKDCC-206ENST00000480099 COL18A1P39060 1754 aa22.1■■□□□ 1.13
PKDCC-206ENST00000480099 NRAPQ86VF7 1730 aa22.09■■□□□ 1.13
PKDCC-206ENST00000480099 CPDO75976 1380 aa22.09■■□□□ 1.13
PKDCC-206ENST00000480099 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.08■■□□□ 1.13
PKDCC-206ENST00000480099 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PKDCC-206ENST00000480099 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.08■■□□□ 1.12
PKDCC-206ENST00000480099 CHRNA2Q15822 529 aa22.07■■□□□ 1.12
PKDCC-206ENST00000480099 ABCC6O95255 1503 aa22.06■■□□□ 1.12
PKDCC-206ENST00000480099 AFF2P51816 1311 aa22.05■■□□□ 1.12
PKDCC-206ENST00000480099 PEAK1Q9H792 1746 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-206ENST00000480099 FAM83GA6ND36 823 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-206ENST00000480099 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-206ENST00000480099 FBLN1P23142 703 aa22.03■■□□□ 1.12
PKDCC-206ENST00000480099 AMPHP49418 695 aa22.03■■□□□ 1.12
PKDCC-206ENST00000480099 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PKDCC-206ENST00000480099 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PKDCC-206ENST00000480099 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.02■■□□□ 1.12
PKDCC-206ENST00000480099 SLIT2O94813 1529 aa22.02■■□□□ 1.12
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