RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-204ENST00000476231 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.12■■□□□ 1.61
SYF2-204ENST00000476231 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.11■■□□□ 1.61
SYF2-204ENST00000476231 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SYF2-204ENST00000476231 ACEP12821 1306 aa25.11■■□□□ 1.61
SYF2-204ENST00000476231 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SYF2-204ENST00000476231 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.09■■□□□ 1.61
SYF2-204ENST00000476231 NUTM2FA1L443 756 aa25.09■■□□□ 1.61
SYF2-204ENST00000476231 ZNF521Q96K83 1311 aa25.09■■□□□ 1.61
SYF2-204ENST00000476231 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.09■■□□□ 1.61
SYF2-204ENST00000476231 NME9Q86XW9 330 aa25.09■■□□□ 1.61
SYF2-204ENST00000476231 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.09■■□□□ 1.61
SYF2-204ENST00000476231 USP6P35125 1406 aa25.08■■□□□ 1.61
SYF2-204ENST00000476231 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.08■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 APAF1O14727 1248 aa25.07■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.07■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 RUNDC1Q96C34 613 aa25.06■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.06■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 COG3Q96JB2 828 aa25.06■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.06■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.05■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 NWD1Q149M9 1564 aa25.04■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.03■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 POLKQ9UBT6 870 aa25.03■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 SSH2Q76I76 1423 aa25.03■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 GOLGA2Q08379 1002 aa25.02■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
SYF2-204ENST00000476231 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.01■■□□□ 1.59
SYF2-204ENST00000476231 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.01■■□□□ 1.59
SYF2-204ENST00000476231 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25■■□□□ 1.59
SYF2-204ENST00000476231 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SYF2-204ENST00000476231 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25■■□□□ 1.59
SYF2-204ENST00000476231 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SYF2-204ENST00000476231 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.99■■□□□ 1.59
SYF2-204ENST00000476231 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.99■■□□□ 1.59
SYF2-204ENST00000476231 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.99■■□□□ 1.59
SYF2-204ENST00000476231 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SYF2-204ENST00000476231 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SYF2-204ENST00000476231 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.98■■□□□ 1.59
SYF2-204ENST00000476231 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SYF2-204ENST00000476231 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.96■■□□□ 1.59
SYF2-204ENST00000476231 SLFN5Q08AF3 891 aa24.95■■□□□ 1.58
SYF2-204ENST00000476231 FBLN1P23142 703 aa24.94■■□□□ 1.58
SYF2-204ENST00000476231 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.94■■□□□ 1.58
SYF2-204ENST00000476231 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SYF2-204ENST00000476231 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SYF2-204ENST00000476231 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SYF2-204ENST00000476231 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.93■■□□□ 1.58
SYF2-204ENST00000476231 CCDC27Q2M243 656 aa24.93■■□□□ 1.58
SYF2-204ENST00000476231 USP31Q70CQ4 1352 aa24.92■■□□□ 1.58
SYF2-204ENST00000476231 WWC1Q8IX03 1113 aa24.92■■□□□ 1.58
SYF2-204ENST00000476231 E9PSI1 815 aa24.91■■□□□ 1.58
SYF2-204ENST00000476231 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.91■■□□□ 1.58
SYF2-204ENST00000476231 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SYF2-204ENST00000476231 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SYF2-204ENST00000476231 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.89■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.88■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 PIK3C2AO00443 1686 aa24.88■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 FCHSD2O94868 740 aa24.87■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 C14orf37Q86TY3 774 aa24.87■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 WDR63Q8IWG1 891 aa24.87■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.87■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 IL13P35225 146 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 NEUROD2Q15784 382 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 USP54Q70EL1 1684 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.85■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.84■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.83■■□□□ 1.57
SYF2-204ENST00000476231 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-204ENST00000476231 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SYF2-204ENST00000476231 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.81■■□□□ 1.56
SYF2-204ENST00000476231 HSPA2P54652 639 aa24.81■■□□□ 1.56
SYF2-204ENST00000476231 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-204ENST00000476231 NEFMP07197 916 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-204ENST00000476231 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-204ENST00000476231 PEAK1Q9H792 1746 aa24.79■■□□□ 1.56
SYF2-204ENST00000476231 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.79■■□□□ 1.56
SYF2-204ENST00000476231 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SYF2-204ENST00000476231 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.79■■□□□ 1.56
SYF2-204ENST00000476231 NLRP6P59044 892 aa24.78■■□□□ 1.56
SYF2-204ENST00000476231 MSH5O43196 834 aa24.78■■□□□ 1.56
SYF2-204ENST00000476231 PRKAR2BP31323 418 aa24.78■■□□□ 1.56
SYF2-204ENST00000476231 ABTB2Q8N961 1025 aa24.76■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 SBNO1A3KN83 1393 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 PSME1Q06323 249 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 KIF1AQ12756 1690 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-204ENST00000476231 DCCP43146 1447 aa24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111 ms