RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
RALGPS1-212ENST00000472427 MON2Q7Z3U7 1717 aa30.16■■■□□ 2.42
RALGPS1-212ENST00000472427 ALS2Q96Q42 1657 aa30.15■■■□□ 2.42
RALGPS1-212ENST00000472427 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa30.14■■■□□ 2.41
RALGPS1-212ENST00000472427 MYOM1P52179 1685 aa30.13■■■□□ 2.41
RALGPS1-212ENST00000472427 A0A1W2PP64 1363 aa30.13■■■□□ 2.41
RALGPS1-212ENST00000472427 CD163L1Q9NR16 1453 aa30.12■■■□□ 2.41
RALGPS1-212ENST00000472427 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
RALGPS1-212ENST00000472427 TTC21AQ8NDW8 1320 aa30.11■■■□□ 2.41
RALGPS1-212ENST00000472427 NRKQ7Z2Y5 1582 aa30.11■■■□□ 2.41
RALGPS1-212ENST00000472427 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
RALGPS1-212ENST00000472427 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
RALGPS1-212ENST00000472427 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
RALGPS1-212ENST00000472427 ABTB2Q8N961 1025 aa30.1■■■□□ 2.41
RALGPS1-212ENST00000472427 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
RALGPS1-212ENST00000472427 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
RALGPS1-212ENST00000472427 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa30.08■■■□□ 2.41
RALGPS1-212ENST00000472427 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
RALGPS1-212ENST00000472427 SSH2Q76I76 1423 aa30.07■■■□□ 2.4
RALGPS1-212ENST00000472427 KIF7Q2M1P5 1343 aa30.07■■■□□ 2.4
RALGPS1-212ENST00000472427 NLRP13Q86W25 1043 aa30.05■■■□□ 2.4
RALGPS1-212ENST00000472427 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
RALGPS1-212ENST00000472427 PLEKHG5O94827 1062 aa30.04■■■□□ 2.4
RALGPS1-212ENST00000472427 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.4
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC7Q96M83 1385 aa30.03■■■□□ 2.4
RALGPS1-212ENST00000472427 LRP6O75581 1613 aa30.02■■■□□ 2.4
RALGPS1-212ENST00000472427 PIK3C2AO00443 1686 aa30.01■■■□□ 2.4
RALGPS1-212ENST00000472427 NLRP6P59044 892 aa30.01■■■□□ 2.39
RALGPS1-212ENST00000472427 NUTM2GQ5VZR2 741 aa30.01■■■□□ 2.39
RALGPS1-212ENST00000472427 ABCA3Q99758 1704 aa30.01■■■□□ 2.39
RALGPS1-212ENST00000472427 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
RALGPS1-212ENST00000472427 ADAMTS2O95450 1211 aa29.98■■■□□ 2.39
RALGPS1-212ENST00000472427 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.98■■■□□ 2.39
RALGPS1-212ENST00000472427 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
RALGPS1-212ENST00000472427 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.96■■■□□ 2.39
RALGPS1-212ENST00000472427 NSD3Q9BZ95 1437 aa29.96■■■□□ 2.39
RALGPS1-212ENST00000472427 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.96■■■□□ 2.39
RALGPS1-212ENST00000472427 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
RALGPS1-212ENST00000472427 USP19O94966 1318 aa29.95■■■□□ 2.38
RALGPS1-212ENST00000472427 NME9Q86XW9 330 aa29.93■■■□□ 2.38
RALGPS1-212ENST00000472427 PANK3Q9H999 370 aa29.93■■■□□ 2.38
RALGPS1-212ENST00000472427 USP31Q70CQ4 1352 aa29.92■■■□□ 2.38
RALGPS1-212ENST00000472427 C8orf37Q96NL8 207 aa29.92■■■□□ 2.38
RALGPS1-212ENST00000472427 USP54Q70EL1 1684 aa29.91■■■□□ 2.38
RALGPS1-212ENST00000472427 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.91■■■□□ 2.38
RALGPS1-212ENST00000472427 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.91■■■□□ 2.38
RALGPS1-212ENST00000472427 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.91■■■□□ 2.38
RALGPS1-212ENST00000472427 SLIT3O75094 1523 aa29.91■■■□□ 2.38
RALGPS1-212ENST00000472427 NGLY1Q96IV0 654 aa29.89■■■□□ 2.38
RALGPS1-212ENST00000472427 COG3Q96JB2 828 aa29.89■■■□□ 2.38
RALGPS1-212ENST00000472427 CARD14Q9BXL6 1004 aa29.88■■■□□ 2.37
RALGPS1-212ENST00000472427 GCP02774 474 aa29.87■■■□□ 2.37
RALGPS1-212ENST00000472427 KNSTRNQ9Y448 316 aa29.86■■■□□ 2.37
RALGPS1-212ENST00000472427 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.86■■■□□ 2.37
RALGPS1-212ENST00000472427 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.86■■■□□ 2.37
RALGPS1-212ENST00000472427 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.85■■■□□ 2.37
RALGPS1-212ENST00000472427 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
RALGPS1-212ENST00000472427 CPDO75976 1380 aa29.82■■■□□ 2.36
RALGPS1-212ENST00000472427 KIAA0232Q92628 1395 aa29.82■■■□□ 2.36
RALGPS1-212ENST00000472427 AFF2P51816 1311 aa29.82■■■□□ 2.36
RALGPS1-212ENST00000472427 FYB1O15117 783 aa29.82■■■□□ 2.36
RALGPS1-212ENST00000472427 SOX12O15370 315 aa29.82■■■□□ 2.36
RALGPS1-212ENST00000472427 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
RALGPS1-212ENST00000472427 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.82■■■□□ 2.36
RALGPS1-212ENST00000472427 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.82■■■□□ 2.36
RALGPS1-212ENST00000472427 NSD2O96028 1365 aa29.81■■■□□ 2.36
RALGPS1-212ENST00000472427 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.79■■■□□ 2.36
RALGPS1-212ENST00000472427 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.78■■■□□ 2.36
RALGPS1-212ENST00000472427 NFAT5O94916 1531 aa29.77■■■□□ 2.36
RALGPS1-212ENST00000472427 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.77■■■□□ 2.36
RALGPS1-212ENST00000472427 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
RALGPS1-212ENST00000472427 USP21Q9UK80 565 aa29.77■■■□□ 2.36
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM83GA6ND36 823 aa29.76■■■□□ 2.35
RALGPS1-212ENST00000472427 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.76■■■□□ 2.35
RALGPS1-212ENST00000472427 SLIT2O94813 1529 aa29.75■■■□□ 2.35
RALGPS1-212ENST00000472427 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
RALGPS1-212ENST00000472427 CHRNA2Q15822 529 aa29.72■■■□□ 2.35
RALGPS1-212ENST00000472427 ABCC6O95255 1503 aa29.71■■■□□ 2.35
RALGPS1-212ENST00000472427 BTG4Q9NY30 223 aa29.71■■■□□ 2.35
RALGPS1-212ENST00000472427 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.71■■■□□ 2.35
RALGPS1-212ENST00000472427 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.7■■■□□ 2.35
RALGPS1-212ENST00000472427 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.7■■■□□ 2.35
RALGPS1-212ENST00000472427 LTN1O94822 1766 aa29.69■■■□□ 2.34
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
RALGPS1-212ENST00000472427 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
RALGPS1-212ENST00000472427 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.68■■■□□ 2.34
RALGPS1-212ENST00000472427 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.67■■■□□ 2.34
RALGPS1-212ENST00000472427 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
RALGPS1-212ENST00000472427 MORC1Q86VD1 984 aa29.67■■■□□ 2.34
RALGPS1-212ENST00000472427 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
RALGPS1-212ENST00000472427 NRAPQ86VF7 1730 aa29.65■■■□□ 2.34
RALGPS1-212ENST00000472427 EVA1CP58658 441 aa29.65■■■□□ 2.34
RALGPS1-212ENST00000472427 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
RALGPS1-212ENST00000472427 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.64■■■□□ 2.34
RALGPS1-212ENST00000472427 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
RALGPS1-212ENST00000472427 AMPHP49418 695 aa29.63■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 RTL1A6NKG5 1358 aa29.63■■■□□ 2.33
RALGPS1-212ENST00000472427 ATRNO75882 1429 aa29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 185.2 ms