RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469325.5

VAV3-204, Transcript of vav guanine nucleotide exchange factor 3, human

TSL 2

Gene VAV3, Length 2,487 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VAV3-204	ENST00000469325	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		6.71	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	EID1	Q9Y6B2	187 aa		6.71	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	HAX1	O00165	279 aa		6.7	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		6.7	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		6.69	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	NLRP1	Q9C000	1473 aa		6.69	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	LTK	P29376	864 aa		6.69	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	SIRT1	Q96EB6	747 aa		6.69	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		6.69	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	SHPRH	Q149N8	1683 aa		6.69	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	MED14	O60244	1454 aa		6.69	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		6.69	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		6.69	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		6.68	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	CRBN	Q96SW2	442 aa		6.68	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	ATP7B	P35670	1465 aa		6.68	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	TECPR2	O15040	1411 aa		6.68	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		6.68	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	CCDC27	Q2M243	656 aa		6.68	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	WDR63	Q8IWG1	891 aa		6.68	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		6.68	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		6.67	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	PITPNM1	O00562	1244 aa		6.67	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		6.67	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	BCAR3	O75815	825 aa		6.67	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		6.66	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		6.66	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	FBLN1	P23142	703 aa		6.66	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		6.66	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		6.66	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		6.66	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	NUTM2F	A1L443	756 aa		6.66	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	NEFM	P07197	916 aa		6.66	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		6.66	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	COG3	Q96JB2	828 aa		6.66	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	POLK	Q9UBT6	870 aa		6.66	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	C3	P01024	1663 aa		6.65	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	CPS1	P31327	1500 aa		6.65	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		6.65	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		6.65	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		6.65	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		6.65	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	NME9	Q86XW9	330 aa		6.65	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		6.65	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		6.65	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		6.65	□□□□□ -1.34
VAV3-204	ENST00000469325	FCHSD2	O94868	740 aa		6.65	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	TBX22	Q9Y458	520 aa		6.65	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		6.64	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	SPDYE6	P0CI01	402 aa		6.64	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	RIPK4	P57078	832 aa		6.64	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		6.64	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		6.64	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	SLIT1	O75093	1534 aa		6.63	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		6.63	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		6.63	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		6.63	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	PDE3A	Q14432	1141 aa		6.63	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		6.63	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	ACE	P12821	1306 aa		6.63	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		6.63	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		6.62	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		6.62	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	HMOX1	P09601	288 aa		6.62	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	PRKAR2B	P31323	418 aa		6.62	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	PTPRU	Q92729	1446 aa		6.62	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	ADGRB2	O60241	1585 aa		6.62	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		6.61	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		6.61	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		6.61	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	ITSN1	Q15811	1721 aa		6.61	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		6.61	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	PANK1	Q8TE04	598 aa		6.61	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	COG6	Q9Y2V7	657 aa		6.61	□□□□□ -1.35
VAV3-204	ENST00000469325	IL16	Q14005	1332 aa		6.61	□□□□□ -1.35

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